EDIR查询
查询EDIR数据库中的特定基因
生物导体版本：释放（3.19）
EDIRquery提供了一种工具，可以在离散重复序列的外显子数据库（EDIR）中搜索感兴趣的基因。基因名称是必需的输入，用户可以另外指定重复序列长度、序列之间的最小和最大距离，以及是否允许1-bp的不匹配。输出包括按重复长度排列的结果摘要，以及查询结果的数据帧。提供的示例数据包括基因GAA的数据子集（ENSG00000171298）。要查询完整数据库，需要提供下载的数据库文件的路径作为参数。
作者：Laura D.T.Vo Ngoc【aut，cre】
维护人员：Laura D.T.Vo Ngoc<doan.vongoc at vub.be>
引文（从R中输入引文（“EDIRquery”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“EDIRquery”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“EDIRquery”）
细节
| 生物视图 |
遗传学,序列匹配,软件 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
易怒的(>= 3.1.6),tictoc公司（>=1.0.1），utils（>=4.1.3），stats（>=4.13），阅读器(>= 2.1.2),交互集(>= 1.22.0),基因组范围(>= 1.46.1) |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
