EB序列

RNA-seq数据基因和亚型差异表达分析的R包


生物导体版本:释放(3.19)

利用RNA-seq数据进行基因和亚型水平的差异表达分析

作者:马秀玉[cre,aut],冷宁[aut]

维护人员:马秀玉(Xiuyu Ma)<gmail.com上的watsonforfun>

引文(从R中输入引文(“EBSeq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“EBSeq”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“EBSeq”)
EBSeq小品 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,免疫肿瘤学,多重比较,RNA序列,排序,软件,统计方法
版本 2.2.0
生物C 2.13(R-3.0)(11岁)
许可证 艺术-2.0
取决于 块体建模,gplots(gplots),测试那个,R(>=3.0.0)
进口 卢比(>= 0.12.11),RcppEigen基因(>= 0.3.2.9.0)
系统要求 c++11代码
统一资源定位地址
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建议
链接到 卢比,RcppEigen基因,伯克希尔哈撒韦
增强功能
取决于我 奥斯科普
导入我 批次QC,DEsubs公司,标准尽职调查
建议我 编码器
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 EB序列_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 EBSeq_2.2.0.zip码
macOS二进制(x86_64) EBSeq_2.2.0.tgz号
macOS二进制(arm64) EBSeq_2.2.0.tgz号
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBSeq网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/EBSeq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EBSeq网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/EBSeq/
软件包下载报告 下载统计信息