DropletUtils公司
处理单细胞液滴数据的实用程序
生物导体版本：释放（3.19）
提供许多实用功能，用于处理来自10X Genomics等液滴技术的单细胞（RNA-seq）数据。这包括从计数矩阵或分子信息文件中加载数据，从空液滴中识别细胞，去除条形码晃动的假细胞，以及对计数矩阵进行降采样。
作者：亚伦·伦[aut]，乔纳森·格里菲斯[ctb，cre]，戴维斯·麦卡锡[ctb]，东泽·何[ctb].罗伯·帕特罗
维护人员：乔纳森·格里菲斯（Jonathan Griffiths）<Jonathan.Griffiths.94 at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“DropletUtils”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DropletUtils”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“DropletUtils”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,数据导入,基因表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.24.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.7（R-3.5）（6.5岁） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
单细胞实验 |
| 进口 |
utils、stats、methods、，矩阵,卢比,生物遗传学,S4载体,I范围,基因组范围,总结性实验,BiocParallel公司,DelayedArray（延迟阵列）,延迟矩阵统计,HDF5阵列,rhdf5型,边缘R,R.utils公司,dqrng公司,海滩上的人,舷窗 |
| 系统要求 |
C++11，GNU制造 |
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
测试那个,针织物,仿生风格,市场营销,硅钠铝石,DropletTest文件 |
| 链接到 |
卢比,海滩上的人,Rhdf5库,伯克希尔哈撒韦,dqrng公司,舷窗 |
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
高级OSCA.、介绍OSCA.、多样本OSCA.工作流程 |
| 导入我 |
火焰,scCB2型,sc管道,单细胞TK,西班牙猎犬,空间特征实验 |
| 建议我 |
雪花石膏.空间,解复用,蒙莫萨,星云,单细胞通道实验,空间实验,聚光灯,tidy空间实验,DropletTest文件,MerfishData公司,muscData公司,空间LIBD,sc自定义,SoupX系列 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
