差异绑定
ChIP-Seq峰值数据的差分结合分析
生物导体版本：释放（3.19）
使用亲和力（定量）数据计算多个ChIP-seq实验中的差异结合位点。还启用占用（重叠）分析和绘图功能。
作者：罗里·斯塔克[aut，cre]，戈德·布朗[aut]
维护人员：Rory Stark<starkhome.com上的生物导体>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DiffBind”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“DiffBind”）
细节
| 生物视图 |
ATACSeq公司,生物医学信息学,细胞生物学,ChIPSeq公司,DNA序列,差异甲基化,差异峰值呼叫,表观遗传学,功能基因组学,基因调控,组蛋白修饰,甲基Seq,多重比较,规范化,峰值检测,RIPSeq（RIPSeq）,报告写作,排序,软件 |
| 版本 |
3.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 2.9（R-2.14）（13岁） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.0），基因组范围,总结性实验 |
| 进口 |
R彩色啤酒,阿玛普,gplots（gplots），gr设备，利马,基因组比对,位置匹配，统计数据，实用程序，I范围,晶格,系统管道R、工具、，卢比,数字播放器,ggplot2,生物并行，平行，S4载体,Rsamtools软件(>= 2.13.1),DESeq2公司、方法、图形、，gg排斥,阿佩格尔姆,灰烬,灰色列表ChIP |
| 系统要求 |
GNU品牌 |
| 统一资源定位地址 |
https://www.cruk.cam.ac.uk/core-facilities/bioinformatics-core/software/DiffBind |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,测试那个,可发送的,rgl公司,XLConnect（XL连接）,边缘R,计算机辅助焊接,牛基因组,基因组信息Db,剖面（profileplyr）,无线电跟踪器，网格 |
| 链接到 |
Rhtslib公司(>= 1.99.1),卢比 |
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
中国药监会,乌尔坎人 |
| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
