注册打开对于生物20247月24-26日

DNA条形码

这个包裹是已弃用。很可能从Bioconductor中移除。请参阅这个成套设备寿命终止指南了解更多信息。

用于创建和分析下一代测序多路复用实验中使用的DNA条形码的工具


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包提供了创建DNA条形码集的功能,能够纠正插入、删除和替换错误。可以分析现有条形码之间的最小、最大和平均距离。最后,以(可能变异的)条形码开始的读取可以被多路分解,即分配给它们的原始参考条形码。

作者:Tilo Buschmann<Tilo.Buschmann.ac点击gmail.com>

维护人员:Tilo Buschmann<Tilo.Buschmann.ac点击gmail.com>

引文(从R中输入引文(“DNABarcode”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“DNABarcode”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“脱氧核糖核酸条形码”)
DNA条形码 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 预处理,排序,软件
版本 1.34.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 GPL-2基因
取决于 矩阵,并行
进口 卢比(>= 0.11.2),伯克希尔哈撒韦
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 针织物,仿生风格,rmarkdown公司
链接到 卢比,伯克希尔哈撒韦
增强功能
取决于我
导入我 DNA条码兼容性
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 DNA条形码_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 DNA条形码_1.34.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) DNA条形码_1.34.0.tgz
macOS二进制(arm64) 脱氧核糖核酸条形码_1.34.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNABarcode
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/DNA条形码
包短Url https://bioconductor.org/packages/DNABarcode/
软件包下载报告 下载统计信息