DEG图

图表上的两个样本测试

生物导体版本：释放（3.19）

DEGgraph实现了最新的假设测试方法，该方法直接评估特定基因网络是否在两种条件下差异表达。这与更经典的两步方法相比，前者先测试单个基因，然后测试差异表达基因的富集基因集。这些最新的方法考虑了网络的拓扑结构，以产生更强大的检测程序。DEGgraph提供了在任何基因表达数据集上轻松测试所有KEGG通路差异表达的方法和可视化结果的工具。

作者：劳伦特·雅各布（Laurent Jacob）、皮埃尔·诺维亚尔（Pierre Neuvial）和桑德琳·杜多特（Sandrine Dudoit）

维护人员：劳伦特·雅各布（Laurent Jacob）

引文（从R中输入引文（“DEGgraph”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DEGgraph”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“DEGgraph”）

DEGgraph：基因网络的差异表达测试	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	决策树,差异表达式,图形和网络,微阵列,网络,网络丰富,软件
版本	1.56.0
在生物导体中	生物碳2.7（R-2.12）（14年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=2.10.0），R.utils公司
进口	图表,KEG图形,晶格,mvtnorm公司,R.方法S3,苏格兰皇家银行,Rgraphviz公司,rrcov公司,NCI图表
系统要求
统一资源定位地址

建议	公司,领域,图表,KEG图形,晶格,结婚,苏格兰皇家银行,rrcov公司,Rgraphviz公司,NCI图表
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	德格拉普-1.56.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEGraph
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/DEGraph
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DEGraph网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/DEGgraph网站/
软件包下载报告	下载统计信息