DAME查找器

发现DAMEs-差异的等位甲基化区域

生物导体版本：释放（3.19）

“DAMEfinder”提供了获取methtuple或bismark输出以计算ASM分数和DAME的功能。它还提供了甲基圆图的良好可视化。

作者：斯蒂芬妮·奥朱埃拉[aut，cre]、达妮娅·马查拉布[aut]、马克·罗宾逊[aut]

维护人员：斯蒂芬·奥朱埃拉（Stephany Orjuela）

引文（从R中输入引文（“DAMEfinder”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“DAMEfinder”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“DAMEfinder”）

生物视图	新闻报道,DNA甲基化,差异甲基化,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.0）
进口	统计数据，基因组信息数据库,基因组范围,I范围,S4载体,阅读器,总结性实验,基因组比对,字符串,普利尔,变量注释，平行，ggplot2,Rsamtools软件,生物遗传学、方法、，利马,颠簸猎人,生物串,重塑2,奶牛场，实用程序
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/markrobinsonouzh/DAMEfinder/issues

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个,rtracklayer公司,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	DAME查找器_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	DAMEfinder_1.16.0.zip公司
macOS二进制（x86_64）	DAMEfinder_1.16.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	DAME探测器_11.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAMEfinder网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/DAMEfinder
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DAMEfinder网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/DAMEfinder网站/
软件包下载报告	下载统计信息