复合Db
创建和使用（化学）化合物注释数据库
生物导体版本：释放（3.19）
CompoundDb提供了从各种不同来源（如LipidMaps、HMDB、ChEBI或MassBank）创建和使用（化学）化合物注释数据库的功能。数据库格式允许另外存储MS/MS光谱和化合物信息。该软件包还为Bioconductor的Spectra软件包提供了一个后端，从而使实验MS/MS光谱与数据库中的MS/MS谱相匹配。数据库可以以SQLite格式存储，因此是可移植的。
作者：简·斯坦斯特鲁普
，约翰内斯·雷纳，乔塞普·巴迪亚，罗杰·吉，安德里亚·维奇尼
维护人员：约翰内斯·雷纳（Johannes Rainer）<Johannes.Rainer at eurac.edu>
引文（从R中输入引文（“CompoundDb”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CompoundDb”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“复合Db”）
细节
| 生物视图 |
注释,质谱学,代谢组学,软件 |
| 版本 |
1.8.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.1），方法，批注筛选器,S4载体 |
| 进口 |
生物遗传学,化学工程师,易怒的,jsonlite公司,数字播放器,数据库接口,dbplyr公司,RSQ岩,博科生物,ProtGenerics公司(>= 1.35.3),xml 2语言,I范围,光谱(>= 1.9.12),MsCoreUtils（MsCore实用程序）,MetaboCoreUtils（元核心实用程序）,生物并行 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/CompoundDb |
| 错误报告 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/CompoundDb/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
