化学工程师

R的化学信息学工具包


生物导体版本:释放(3.19)

ChemmineR是一个用于分析R中类药物小分子数据的化学信息学软件包。其最新版本包含高效处理大量分子、物理化学/结构属性预测、结构相似性搜索、,使用多种算法对复合库进行分类和聚类。此外,它还提供了化合物聚类结果和化学结构的可视化功能。

作者:Y.Eddie Cao、Kevin Horan、Tyler Backman、Thomas Girke

维护人员:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)

引文(从R中输入引文(“ChemmineR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ChemmineR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ChemmineR”)
化学工程师 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
自述文件 文本
新闻 文本

细节

生物视图 生物医学信息学,基于单元格的消息,化学信息学,群集,数据导入,基础设施,代谢组学,微量滴定平板分析,药物遗传学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化
版本 3.56.0
在生物导体中 生物活性炭2.3(R-2.8)(16年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=2.10.0),方法
进口 罗杰森,图形,统计数据,RCurl(RCurl),数据库接口,消化,生物遗传学,卢比(>= 0.11.0),ggplot2,网格,额外网格,png公司,base64enc标准,DT公司,rsvg公司,硅钠铝石,斯特林吉
系统要求 GNU品牌
统一资源定位地址 https://github.com/girke-lab/ChemmineR
查看更多
建议 RSQ网站,散点图3d,gplots(gplots),fmcsR公司,,RPostgreSQL,仿生风格,针织物,针织物,针织靴带,化学药物,png公司,市场营销,生物技术经理,围巾
链接到 卢比,伯克希尔哈撒韦
增强功能 化学OB
取决于我 爱尔兰共和国,fmcsR公司,化学药物
导入我 生物测定R,复合Db,自定义CMPdb,爱尔兰共和国,fmcsR公司,MetID(气象ID),化学博士,DrugSim2DR药物模拟2DR,DRviaSPCN公司
建议我 化学OB,xnet网络
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 化学品R_3.56.0.tar.gz
Windows二进制 ChemmineR_3.56.0.zip化学药品
macOS二进制(x86_64) 化学药品R_3.56.0.tgz
macOS二进制(arm64) 化学药品R_3.56.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/ChemmineR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ChemmineR公司/
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