化学OB
OpenBabel功能子集的R接口
生物导体版本:释放(3.19)
ChemmineOB为OpelBabel C++项目实现的化学信息学功能子集提供了一个R接口。OpenBabel是一个开源化学信息学工具箱,包括用于结构-格式转换、描述符计算、化合物相似性搜索等的实用程序。ChemineOB旨在从R中提供这些实用程序的一个子集。对于非开发人员,ChemineOB主要用于ChemmineR作为附加包,而不是直接使用。
作者:凯文·霍兰(Kevin Horan)、托马斯·吉尔克(Thomas Girke)
维护人员:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)
引文(从R中输入引文(“ChemmineOB”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ChemmineOB”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览Vignette(“ChemmineOB”)
细节
生物视图 |
生物医学信息学,基于细胞的分析,化学信息学,群集,数据导入,基础设施,代谢组学,微量滴定平板分析,药物遗传学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 |
1.42.0 |
在生物导体中 |
生物技术2.13(R-3.0)(10.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=2.15.1),方法 |
进口 |
生物遗传学,zlibbico公司,卢比(>= 0.11.0) |
系统要求 |
带标题的OpenBabel(>=3.0.0)(http://openbabel.org). 带标题的特征3。 |
统一资源定位地址 |
https://github.com/girke-lab/ChemmineOB |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。