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化学OB

OpenBabel功能子集的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

ChemmineOB为OpelBabel C++项目实现的化学信息学功能子集提供了一个R接口。OpenBabel是一个开源化学信息学工具箱,包括用于结构-格式转换、描述符计算、化合物相似性搜索等的实用程序。ChemineOB旨在从R中提供这些实用程序的一个子集。对于非开发人员,ChemineOB主要用于ChemmineR作为附加包,而不是直接使用。

作者:凯文·霍兰(Kevin Horan)、托马斯·吉尔克(Thomas Girke)

维护人员:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)

引文(从R中输入引文(“ChemmineOB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ChemmineOB”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“ChemmineOB”)
化学OB HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
安装 文本
许可证 文本

细节

生物视图 生物医学信息学,基于细胞的分析,化学信息学,群集,数据导入,基础设施,代谢组学,微量滴定平板分析,药物遗传学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(10.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=2.15.1),方法
进口 生物遗传学,zlibbico公司,卢比(>= 0.11.0)
系统要求 带标题的OpenBabel(>=3.0.0)(http://openbabel.org). 带标题的特征3。
统一资源定位地址 https://github.com/girke-lab/ChemmineOB
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建议 化学工程师,生物风格,针织物,针织靴带,生物技术经理,rmarkdown公司,RUnit(运行单位)
链接到 伯克希尔哈撒韦,卢比,zlibbico公司
增强功能 化学工程师(>= 2.13.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 化学OB_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 化学品OB_1.42.0.zip
macOS二进制(x86_64) 化学OB_1.42.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineOB网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/ChemmineOB
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineOB网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ChemmineOB网站/
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