赛利德

基于多重对应分析的单细胞基因特征无偏提取

生物导体版本：释放（3.19）

CelliD是一种无聚类的多元统计方法，用于从单细胞RNA-seq稳健提取per-cell基因特征。CelliD允许跨不同供体、原生质组织、模型生物和单细胞组学协议进行无偏见的细胞身份识别。该软件包还可用于探索单细胞数据中的功能途径富集。

作者：阿基拉·科尔塔尔[aut，cre]，安东尼奥·劳塞尔[aut、ctb]

维护人员：Akira Cortal网站

引文（从R中输入引文（“CelliD”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CelliD”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“CelliD”）

生物视图	ATAC当量,群集,尺寸缩减,基因表达式,GeneSet扩展,RNA序列,单个单元格,软件
版本	1.12.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	GPL-3+文件许可证
取决于	R（>=4.1），修拉(>= 4.0.1),单细胞实验
进口	卢比,RcppArmadillo公司，统计，实用程序，矩阵,tictoc公司,散射,字符串,厄尔巴,数据表,胶,pbapply（应用程序）,乌玛,Rtsne公司,网状的,快速比赛,矩阵统计,ggplot2,生物并行,摘要实验,fgsea公司
系统要求
统一资源定位地址

建议	针织物,rmarkdown公司,仿生风格,测试那个,潮韵诗,ggpubr公司,命运,gg排斥
链接到	卢比,RcppArmadillo公司
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	CelliD_1.12.0.tar.gz手机
Windows二进制	CelliD_1.12.0.zip手机
macOS二进制（x86_64）	CelliD_1.12.0.tgz手机
macOS二进制（arm64）	CelliD_1.12.0.tgz手机
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CelliD
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/CelliD
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CelliD（网址：https://code.bioconductor.org/browse/CelliD）/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/CelliD网站/
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