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细胞混合物S

评估细胞特定混合


生物导体版本:释放(3.19)

CellMixS提供指标和功能,以评估单细胞分辨率的单细胞转录组数据中的批处理效应、数据集成和批处理效应校正。结果可以在不同级别上进行可视化和总结,例如在单元格、单元格类型或数据集级别上。

作者:阿尔穆特·吕特格[aut,cre]

维护人员:Almut Lütge<Almut.luetge at uzh.ch>

引文(从R中输入引文(“CellMixS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CellMixS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“CellMixS”)
探索数据集成和批处理效果 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果)基因表达式单个单元格软件转录组学
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 k样本,R(>=4.0)
进口 生物邻居ggplot2散射翡翠色奶牛场总结性实验单细胞实验第三年马格里特数字播放器ggridges公司,统计,呜呜声、方法、,生物并行生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/almutlue/CellMixS
错误报告 https://github.com/almutlue/CellMixS/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 单元格混合S_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 手机混音S_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64) 单元格混合S_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 细胞混合S_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellMixS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CellMixS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CellMixS网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CellMixS/
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