类别

类别分析


生物导体版本:释放(3.19)

用于执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman[aut]、Seth Falcon[ctb]、Deepayan Sarkar[ctb]、Robert Castelo[ctb]、Bioconductor Package Maintainer[cre]

维护人员:Bioconductor Package Maintainer<维护人员在Bioconductor.org>

引文(从R中输入引文(“类别”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“类别”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“类别”)
使用类别分析微阵列数据 PDF格式 R脚本
使用染色体带作为类别 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,GO(开始),GeneSet扩展,路径,软件
版本 2.70.0
在生物导体中 BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 方法,统计4,生物遗传学,注释Dbi,博科生物,矩阵
进口 utils、stats、,图表,苏格兰皇家银行,GSEA基地,基因过滤器,注释,数据库接口
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 电子束阵列,所有,Rgraphviz公司,R彩色啤酒,可发送的(>= 1.4-6),hgu95av2.db型,KEGGREST公司,核倍体R,基因绘图仪,利马,晶格,RUnit(运行单位),组织S.c.sgd.db,GOstats公司,政府.db
链接到
增强功能
取决于我 GOstats公司
导入我 类别比较,单元格HTS2,GmicR公司,交互式显示,梅瑟,米尔拉布,表型试验,scTensor公司
建议我 qp图,Rn珠子,maGUI(主图形用户界面)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 类别_2.70.0.tar.gz
Windows二进制 类别_2.70.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 类别_2.70.0.tgz
macOS二进制(arm64) 类别_2.70.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/类别
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/类别
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Category网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/类别/
软件包下载报告 下载统计信息