CTexplorerR公司
探索癌症睾丸基因
生物导体版本：释放（3.19）
CTexploreR包重新定义了癌症睾丸/生殖系（CT）基因列表。它基于公开的RNAseq数据库（GTEx、CCLE和TCGA），总结了CT基因的主要特征。一些可视化功能允许探索其在不同类型的组织和癌细胞中的表达，或检查其启动子在正常组织中的甲基化状态。
作者：阿克塞尔·洛里奥
，朱莉·德维斯[aut]，安娜·迪亚科福塔基[ctb]，查尔斯·德·斯梅特[ths]，劳伦特·加托[aut，ths]
维护人员：阿克塞尔·洛里奥在uclouvane.be>
引文（从R中输入引文（“CTexploreR”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CTexploreR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“CTexploreR”）
细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,数据导入,差异表达式,表观遗传学,实验中心软件,基因表达式,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.3），CT数据 |
| 进口 |
生物遗传学,复杂热图，网格，总结性实验,基因组范围,I范围,数字播放器,第三年,易怒的,ggplot2,爱尔兰航空公司，gr设备，统计，绕圈子,gg排斥,单细胞实验,矩阵泛型 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/UCLouvain-CBIO/CTexploreR |
| 错误报告 |
https://github.com/UCLouvain-CBIO/CTexploreR/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
