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CHRONOS公司

CHRONOS:一种用于microRNA介导的亚途径富集分析的时变方法


生物导体版本:释放(3.19)

用于有效揭示路径固有动态特性的软件包。通过利用连接基因/微RNA的时间转换和折叠变化活性提取和评估微RNA介导的亚通路拓扑。

作者:Aristidis G.Vrahatis、Konstantina Dimitrakopoulou、Panos Balomenos

维护人员:帕诺斯·巴洛梅诺斯(Panos Balomenos)

引文(从R中输入引文(“CHRONOS”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CHRONOS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“CHRONOS”)
CHRONOS公司 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形和网络,KEGG公司,路径,软件,系统生物学
版本 1.32.0
在生物导体中 生物C 3.3(R-3.3)(8年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.5)
进口 XML格式,RCurl(RCurl),苏格兰皇家银行,平行,foreach公司,do并行,开放式xlsx,记录仪,绕圈子,图表,stats,utils,grDevices,图形,方法,生物反应器,rJava软件
系统要求 Java版本>=1.7,Pandoc
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 时间1.32.0.tar.gz
Windows二进制 CHRONOS_1.32.0.zip码(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 染色体_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CHRONOS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CHRONOS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CHRONOS网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CHRONOS/
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