生物OncoTK

用于普通癌症基因组学的生物导体组件

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“BiocOncoTK”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

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浏览幻影（“BiocOncoTK”）

BiocOncoTK——生物导体的癌症导向组件	HTML格式	R脚本
策划MSIData概述	HTML格式	R脚本
将TCGA肿瘤代码映射到NCIT	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

细节

生物视图	副本编号变化,CpGIsland公司,DNA甲基化,基因表达式,遗传变异性,免疫肿瘤学,SNP公司,软件,转录
版本	1.24.0
在生物导体中	生物技术3.7（R-3.5）（6.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.6.0），方法，实用程序
进口	复杂热图,S4载体,大查询,闪亮的，统计，高温气冷堆,罗杰森,数字播放器,马格里特，网格，DT公司,基因组范围,I范围,ggplot2,总结性实验,数据库接口,基因组特征,管理的TCGA数据,规模,ggpubr公司,普利尔,汽车,图表,Rgraphviz公司,MASS（质量），gr设备
系统要求
统一资源定位地址

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建议	针织物,dbplyr公司,组织Hs.eg.db,多重分析实验,生物风格,个体过程,本体论图,波哥斯人,基因组信息Db,剩余SE(>= 1.3.7),生物文件缓存,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,博科生物,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg18.known基因,重新整形2,测试那个,注释Dbi,FDb公司。无限甲基化.hg19,EnsDb公司。哈皮恩斯v75,rmarkdown公司,rhdf5客户端,批注中心
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	BiocOncoTK_1.24.0.tar.gz公司
Windows二进制	生物肿瘤TK_1.24.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	BiocOncoTK_1.24.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	BiocOncoTK_1.24.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocOncoTK
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/BiocOncoTK
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BiocOncoTK/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/BiocOncoTK/
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