生物质量控制

用基因集检测表达谱中的组织异质性

生物导体版本：释放（3.19）

BioQC基于组织基因签名对高通量表达数据进行质量控制。它可以检测基因表达数据中的组织异质性。核心算法是针对高性能进行优化的Wilcoxon-Mann-Whitney测试。

作者：Jitao David Zhang[cre，aut]，Laura Badi[aut]

维护人员：Jitao David Zhang在roche.com>上的Jitao_David.Zhang

引文（从R中输入引文（“BioQC”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“BioQC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“BioQC”）

BioQC算法：加快Wilcoxon-Mann-Whitney检验	HTML格式	R脚本
生物质量控制基准：在模拟和真实数据上测试生物质量控制的效率、敏感性和特异性	HTML格式	R脚本
BioQC-肾脏：肾脏表达示例	HTML格式	R脚本
BioQC：检测基因表达数据中的组织异质性	HTML格式	R脚本
Wilcoxon-Mann-Whitney与其他统计检验的比较	HTML格式	R脚本
使用带有签名基因集的BioQC	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

生物视图	基因表达式,GeneSet扩展,质量控制,软件,统计方法
版本	1.32.0
在生物导体中	生物C 3.3（R-3.3）（8年）
许可证	GPL（>=3）+文件许可证
取决于	R（>=3.5.0），博科生物
进口	边缘R,卢比，方法，统计信息，实用工具
系统要求
统一资源定位地址	https://accio.github.io/生物质量控制
错误报告	https://accio.github.io/BioQC/issues网站

建议	测试那个,针织物,rmarkdown公司,晶格,额外晶格,红色基准线,gplots（gplots）,额外网格,组织Hs.eg.db,hgu133加2.db,ggplot2,重塑2,普利尔,ineq公司,冠状病毒,利马,R彩色啤酒
链接到	卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	生物质量控制_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	生物质量_1.32.0.zip
macOS二进制（x86_64）	生物QC_1.32.0.tgz
macOS二进制（arm64）	生物QC_1.32.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioQC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/生物质量控制
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BioQC/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/BioQC/
软件包下载报告	下载统计信息