绑定SiteFinder
基于iCLIP数据的结合位点定义
生物导体版本：释放（3.19）
准确了解RNA-结合蛋白（RBP）的结合位点是理解（转录后）调控过程的关键。这里我们提供了一个工作流，描述了如何从iCLIP数据中定义准确的绑定站点。该包提供了绑定站点定义和结果可视化的功能。有关详细信息，请参阅小插曲。
作者：米尔科·布鲁格曼[aut，cre]
，凯西·扎纳克[aut]
维护人员：米尔科·布鲁格曼（Mirko Brüggemann）
引文（从R中输入引文（“BindingSiteFinder”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“BindingSiteFinder”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“BindingSiteFinder”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,数据导入,功能基因组学,基因表达式,基因调控,排序,软件 |
| 版本 |
2.2.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
基因组范围，R（>=4.2） |
| 进口 |
第三年,易怒的,普利尔,矩阵统计，统计，ggplot2、方法、，rtracklayer公司,S4载体,gg力,基因组信息Db,复杂热图,R彩色啤酒,生命周期,爱尔兰航空公司,预测,数字播放器,基因组特征,I范围,kableExtra（额外）,ggdist（ggdist） |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/ZarnackGroup/BindingSiteFinder/issues |
查看更多
| 建议 |
测试那个,仿生风格,针织物,rmarkdown公司,基因组比对,规模,Gviz公司,xlsx公司,GGally公司,拼凑,翡翠色,ggplotify公司,总结性实验,DESeq2公司,gg点密度,ggrastr公司,灰烬 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
