AnVIL工作流

运行Terra/AnVIL工作区中实现的工作流


生物导体版本:释放(3.19)

AnVIL是由美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)部分开发的云计算资源。AnVIL项目驱逐的主要基于云的基因组学平台是Terra。AnVILWorkflow包允许远程访问Terra实现的工作流,使最终用户能够通过传统R功能利用Terra/AnVIL提供的资源,例如数据、工作流和灵活/可缩放的计算资源。

作者:Sehyun Oh【aut,cre】,Kai Gravel-Pucillo[aut]

维护人员:Sehyun Oh<gmail.com上的shbrief>

引文(从R中输入引文(“AnVILWorkflow”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“AnVIL工作流”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“AnVIL工作流”)
快速入门:示例1。利用鲑鱼进行RNAseq分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2.0)
进口 实用程序,AnVIL公司,高温气冷堆、方法、,jsonlite公司,数字播放器,易怒的
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/shbrief/AnVILWorkflow/issues
查看更多
建议 针织物,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 AnVIL工作流_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 AnVIL工作流_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) AnVIL工作流_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) AnVIL工作流_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnVIL工作流
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/AnVIL工作流
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AnVIL工作流/
包短Url https://bioconductor.org/packages/AnVIL工作流/
软件包下载报告 下载统计信息