AnVIL公司

AnVIL计算环境中的生物导体

生物导体版本：释放（3.19）

AnVIL是由美国国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute）部分开发的云计算资源。AnVIL包提供最终用户和开发人员功能。对于最终用户，AnVIL提供了快速二进制软件包安装、用于处理Terra/AnVIL表和数据资源的实用程序，以及用于在Google云存储中来回移动文件的便利功能。对于开发人员来说，AnVIL提供了对Terra、Leonardo、Rawls和Dockstore RESTful编程接口的程序访问，包括将JSON响应转换为更易于在R中操作的格式的辅助函数。

作者：马塞尔·拉莫斯[aut，cre]，马丁·摩根、凯拉·Interdonato[aut]、Yubo Cheng[aut'、Nitesh Turaga[aut]BJ Stubbs[ctb]、Vincent Carey[ctb]、Sehyun Oh[ctb]Sweta Gopaulakrishnan[ctb]Valerie Obenchain

维护人员：马塞尔·拉莫斯<Marcel.Ramos at roswellpark.org>

引文（从R中输入引文（“AnVIL”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“AnVIL”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“AnVIL”）

AnVIL的Dockstore和Bioconductor	HTML格式	R脚本
AnVIL包简介	HTML格式	R脚本
在R中运行AnVIL工作流	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	基础设施,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.6），数字播放器
进口	stats、utils、方法，无用的日志,jsonlite公司,高温气冷堆,欣喜若狂的(>= 0.1.3),山药,易怒的,潮汐选择,第三年,爱尔兰航空公司,闪亮的,DT公司,迷你用户界面,html工具,生物管理器,生物基Utils
系统要求
统一资源定位地址

建议	平行，针织物,rmarkdown公司,测试那个,用r,阅读器,仿生风格,开发工具
链接到
增强功能
取决于我	cBioPortalData公司,terraTCGA数据
导入我	AnVIL发布,AnVIL工作流
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	AnVIL_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	AnVIL_1.16.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	AnVIL_1.16.0.tgz
macOS二进制（arm64）	AnVIL_1.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnVIL
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/AnVIL
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AnVIL/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/AnVIL/
软件包下载报告	下载统计信息