阿尔卑斯核磁共振

核磁共振波谱自动处理系统


生物导体版本:释放(3.19)

读取压缩和解压缩的Bruker NMR数据目录。它为非目标核磁共振代谢组学提供了自动化和高效的信号处理。它能够插值样本、检测异常值、排除区域、归一化、检测峰值、对齐光谱、集成峰值、管理元数据和可视化光谱。经过光谱处理后,可以对提取的数据进行多元分析。还可以使用一维数据进行高效绘图。还提供了1D ACD/Labs导出JDX样本的基本读数。

作者:伊万·蒙托利乌·鲁拉[aut],塞尔吉奥·奥勒·莫雷诺[aut,cre],弗朗西斯科·马德里·甘宾[aut],路易斯·费尔南德斯[aut],Laura López Sánchez[ctb],Héctor Gracia Cabrera[aut],Santiago Marco ColáS[aut],雀巢健康科学研究所,加泰罗尼亚生物工程研究所

维护人员:塞尔吉奥·奥勒·莫雷诺(Sergio Oller Moreno)

引文(从R中输入引文(“AlpsNMR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“AlpsNMR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“AlpsNMR”)
AlpsNMR(软分离API)的早期介绍 PDF格式 R脚本
Vignette 01:AlpsNMR简介(从这里开始) PDF格式 R脚本
渐晕图02:处理元数据和注释 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 化学信息学,分类,数据导入,代谢组学,预处理,软件,可视化
版本 4.6.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(4年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.2),未来(>= 1.10.0)
进口 实用程序,泛型、图形、统计、grDevices、,气候变化指数,马格里特(>= 1.5),数字播放器(>= 1.1.0),信号(>= 0.7-6),拉朗(>= 0.3.0.1),规模(>= 1.2.0),字符串(>= 1.3.1),易怒的(>= 1.3.4),第三年(>= 1.0.0),潮汐选择,读xl(>= 1.1.0),呜呜声(>= 0.2.5),(>= 1.2.0),重塑2(>= 1.4.3),mixOmics公司(>= 6.22.0),矩阵统计(>= 0.54.0),英尺(>= 1.2.6),rmarkdown公司(>= 1.10),说话(>= 2.4.0),html工具(>= 0.3.6),pcaPP公司(>= 1.9-73),ggplot2(>= 3.1.0),基线(>= 1.2-1),录像机(>= 0.3.0),生物并行
系统要求
统一资源定位地址 https://sipss.github.io/AlpsNMR/ https://github.com/sipss/AlpsNMR
错误报告 https://github.com/sipss/AlpsNMR/issues
查看更多
建议 仿生风格,化学规范,奶牛场,卷曲,DT公司(>= 0.5),GGally公司(>= 1.4.0),gg排斥(>= 0.8.0),额外网格,针织物,巧妙地(>= 4.7.1),进步者,总结性实验,S4载体,测试那个(>= 2.0.0),Writex(写入)(>= 1.0),拉链(>= 2.0.4)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 阿尔卑斯山NMR_4.6.0.tar.gz
Windows二进制 阿尔卑斯山NMR_4.6.0.zip
macOS二进制(x86_64) 阿尔卑斯山NMR_4.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) 阿尔卑斯山NMR_4.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AlpsNMR网址
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/AlpsNMR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AlpsNMR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/AlpsNMR/
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