过敏性失衡
研究等位基因特异表达
生物导体版本:释放(3.19)
为使用RNA-seq数据进行等位基因特异性表达研究提供了一个框架。
作者:杰斯珀·加丁(Jesper R Gadin)、拉斯·福克森(Lasse Folkersen)
维护人员:杰斯珀·加丁(Jesper R Gadin)<j.R.Gadin at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“AllelicImbalance”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“AllelicImbalance”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“AllelicImbalance”)
细节
生物视图 |
遗传学,基础设施,排序,软件 |
版本 |
1.42.0 |
在生物导体中 |
生物技术2.13(R-3.0)(11年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.0.0),网格,基因组范围(>= 1.31.8),总结性实验(>= 0.2.0),基因组比对(>= 1.15.6) |
进口 |
方法,生物遗传学,注释Dbi,牛基因组(>= 1.47.3),变量注释(>= 1.25.11),生物串(>= 2.47.6),S4载体(>= 0.17.25),I范围(>= 2.13.12),Rsamtools软件(>= 1.99.3),基因组特征(>= 1.31.3),Gviz公司,晶格,额外格子,额外网格,顺序,基因组信息Db,国家实验室 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance网站 |
错误报告 |
https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。