APL公司
关联图
生物导体版本：释放（3.19）
APL是一个用于计算关联图（AP）的软件包，关联图是一种可视化和分析单细胞转录组数据的方法。APL的主要重点是从输入数据中识别单个细胞簇的基因特征。该软件包执行对应分析（CA），并允许使用关联图识别集群特异性基因。此外，APL计算所有基因的簇特异性得分，从而根据所选感兴趣的细胞簇的特异性对基因进行排序。
作者：克莱门斯·科尔[cre，aut]，埃尔兹比亚特·格拉林斯卡[aut]
维护人员：克莱门斯·科尔（Clemens Kohl）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“APL”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“APL”）
细节
| 生物视图 |
尺寸缩减,基因表达式,RNA序列,排序,单个单元格,软件,统计方法 |
| 版本 |
1.8.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2.5年） |
| 许可证 |
GPL（>=3） |
| 取决于 |
R（>=4.2） |
| 进口 |
网状的,gg排斥,ggplot2,绿柱石,巧妙地,修拉,单细胞实验,马格里特,总结性实验,topGO（顶GO），方法，统计，实用程序，组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,爱尔兰航空公司,矩阵 |
| 系统要求 |
巨蟒、pytorch、numpy |
| 统一资源定位地址 |
https://vingronlab.github.io/APL网站/ |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
