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多层加权基因共表达网络的活性模块:一种连续优化方法


生物导体版本:释放(3.19)

一个纯数据驱动的基因网络,加权基因共表达网络(WGCN)只能从表达谱构建。此类网络中的不同层可能代表不同的时间点、多种条件或不同种类。AMOUNTAIN旨在使用连续优化方法搜索多层WGCN中的活动模块。

作者:李东、何山、潘志松、胡谷雨

维护人员:李东<dxl466 at cs.bham.ac.uk>

引文(从R中输入引文(“AMOUNTAIN”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“AMOUNTAIN”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“AMUNTAIN”)
渐晕图标题 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,基因表达式,微阵列,网络,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 生物化学3.4(R-3.3)(8年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.3.0)
进口 统计数据
系统要求 全球供应链
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 金额_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 金额_1.30.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 阿莫斯坦_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) 金额_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/AMOUNTAIN
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AMOUNTAIN网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN网站/
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