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密歇根州立大学Wei实验室
环境与社会保障局
欧拉溶剂排除表面软件
建造
ESES输入
输入蛋白质
示例:3ao4
或上传您的
*.pdb文件
或
*.xyzr型
文件(<2MB)
文件上传(_U)
选择文件
更改
半径(Å)=
探头球半径[0.1Å,10.0]
网格大小(Å)=
网格分辨率不低于0.2Å。对于较小的网格尺寸,使用离线软件
扩展(Å)=
边界框的扩展[1Å,10.0]
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用户指南
ESES是一个在笛卡尔网格中生成精确溶剂排除表面(SES)的软件。它是一个开放源代码,可以在
GitHub上的Weilab
结果是一个包含以下内容的zip文件
ESES.log日志:
ESES软件的日志文件
MC_结果对象:
表面表示可以通过PyMOL等分子软件可视化。
bounding_box.txt、grid_info.txt、intersection_info.text:
提供笛卡尔坐标系中的表面的网格相关信息。
本地库
工具书类
1
刘蓓蓓,王宝,赵润东,童一英,魏国伟,ESES:欧拉溶剂排除表面软件,计算化学杂志,38,446-466(2017)。
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2
赵润东,王梦伦,童一英,魏国伟,大规模欧拉溶剂排除表面的分而治之战略,信息与系统通信,18,299-329(2018)
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