华威系统生物中心（WSB）代表了华威大学1100万英镑的投资，以创建一个自主中心，利用多学科研究的优势。 我们结合了实验和数学方法，专注于将模型与当代细胞和分子数据的巨大容量和多样性联系起来；例如来自高通量、全基因组和成像技术的。 我们的目标是提高对复杂生物系统的理解，以便能够解决广泛的生物和医学优先事项，例如疾病机制、药物发现、药物靶点验证以及园艺和农业方面的挑战。

系统生物学涉及通过系统组件相互作用的数学和计算建模来发展对生物系统的理解，从而以定性和定量的方式表达这种理解。区别现代系统生物学方法的一个关键特征是将建模与当代细胞和分子数据的巨大容量和多样性联系起来，例如来自高通量、全基因组和成像技术的数据。了解复杂的生物过程将使我们能够解决许多重要问题，并对解决广泛的生物和医学优先事项至关重要，如疾病机制、药物发现、药物靶点验证以及园艺和农业。

这个沃里克系统生物中心（WSB）沃里克大学成立于2004/5年，以其在多学科研究、数学和物理科学以及生命科学方面的优势为基础。这项初步投资为任命11名新工作人员、专门设计的住所以及大量实验和计算设备提供了资金。此后，全校又任命了几名对系统生物学感兴趣的工作人员。该中心是一个自治机构，与医学院、生命科学院和数学系有联合工作人员。它还与化学、物理和统计系有着特别紧密的联系。2006年夏天，它搬进了自己的新住所。该中心的主任是大卫·兰德教授。

该中心的一个独特卖点是它为其生物项目带来的数学、统计和生物信息学技能的优势和广度。这些技能是SB的关键，因为许多SB项目提出了前沿的数学挑战，许多生物项目产生的数据需要复杂的数学分析和建模，而这些往往需要开发新的统计工具。除了员工和合作者的个人研究计划外，WSB的科学计划还围绕着一些重大项目进行。从分子水平到整个有机体，涵盖了非常广泛的生物系统，我们使用并开发了用于一组非常广泛的数据类型的工具。此类交叉干燥技术的开发领域包括网络重建、成像、转录动力学、启动子分析、模型分析和实验优化。

该中心有一个三人生物信息学支持小组，由一名高级生物信息学软件工程师（Jay Moore）和两名初级生物信息学家（Clare Boddington，目前正在任命）组成。此外，还有一个联合系统管理员和科学程序员（保罗·布朗）。这些人员支持数据库和数据管理、数据捕获和基本处理，以及处理复杂数据（如ChIP-seq和微阵列时间序列）的管道和工作流。此外，它们与我们的研究项目和相关的博士后文档相连接，并为高级分析、创建用户友好的网络工具以及科学和系统计算提供支持。

植物和作物
对我们来说，这是一个非常活跃的领域，在华威有大量的SB拨款，特别是在植物胁迫（例如PRESTA，>500万英镑）、昼夜节律钟和根结瘤方面。进一步发展这个地区的计划很先进。一个重要的发展将是将SB方法扩展到作物，以将网络级的模型和数据连接到作物模型，并处理多个基因。在华威之外，与欧洲集团（尤其是开发生物技术）以及其他英国集团（例如诺丁汉、爱丁堡、约克、埃克塞特、埃塞克斯以及通过500万英镑的ROBuST项目）进行了强有力的合作。

医疗
在生殖健康、代谢医学（如糖尿病和肥胖）、血管医学压力和营养领域，与WMS有特别强大的联合研究计划。与华威以外的团体的合作包括由Mike White领导的一个耗资540万英镑的关于NF-kappaB信号的SABR项目，以及由David Rand领导的干侧SABR项目、一项研究垂体催乳素4-d转录动力学的Wellcome计划拨款、一项耗资300万英镑的BBSRC LoLa拨款（联合I Hugo van den Berg）与加的夫的免疫学家合作，完成T细胞受体激动剂的完整表征，以及跨欧洲的癌症时间生物学ERASysBio+项目（联合协调员David Rand）。与WMS合作，我们正在与利物浦热带医学院在一些共同感兴趣的高影响领域建立实质性合作，例如红细胞-内皮粘附和信号传递、药物设计、杀虫剂运输和耐药性、电子运输链建模和相关代谢。

核心生物学
在华威，与WMS生物医学细胞生物学小组的合作越来越多，例如与机械化学细胞生物学中心在动态微管末端复合体系统生物学领域的合作，以及与Graham Ladds实验室的合作，研究G蛋白信号和细胞极性决定因素。Till Bretschneider和Nigel Burroughs最近的工作主题是细胞运动和肌动蛋白模式形成的建模。Till Bretschneider在细胞极性和肌动蛋白-肌球蛋白细胞骨架组织和重组领域与领导小组有许多其他合作。他是BBSRC赠款“中性粒细胞迁移的三维透视图”的PI，与Babraham研究所的主要生化学家合作，与CI Weijer（Dundee）合作，他在开发期间有一个Wellcome资助的趋化细胞分选项目。
人们对将系统生物学思想应用于生物技术越来越感兴趣，Nigel Burroughs是美国国家科学基金会（NSF）和英国生物安全研究委员会（BBSRC）资助的一个英美团队的成员，该团队致力于多层次方法，以产生更多的二氧化碳用于光合作用。我们认为这是开发合成生物学和代谢工程应用于生物能源项目的起点。
在神经科学领域，WSB为跨学科神经科学做出了积极贡献，这在华威非常活跃。特别是，它促进了整个校园的交流，为年度夏季会议提供了资金支持，马格努斯·理查德森和尤利娅·蒂莫菲耶娃（复杂性）最近组织了一次非常成功的国际会议——树突、神经元和网络。在目前由赠款资助的合作中，Richardson和Mark Wall（生命科学学院）旨在大幅提高华威大学的实验能力，其主要目标是在未来5年内使华威大学成为新皮质空间效应实证驱动模型和理论的领军中心。其他正在进行的合作包括与Bruno Frenguelli（生命科学）关于癫痫预测的联合项目，与Anatoly Shmygol（WMS）关于细胞间钙动力学的联合项目以及由Matthew Turner（物理学）和James Covington（工程学）领导的多学科成像项目。
在微生物学方面，当务之急是跟进SysMO 450万欧元的赠款——天蓝色链霉菌的全球代谢转换（由Liz Wellington领导），以确定磷酸盐、碳和氮的利用网络，从环境监测到它们对次级代谢谱的影响。

横切干燥技术
沃里克中心的一个显著特点是，它注重利用数学和统计技能开发数据和模型分析工具。我们开发此类工具的领域包括：
¥成像：例如用于跟踪细胞的工具（Bretschneider和Du），从z堆栈重建膜等（Burroughs），移动细胞中细胞膜动力学的高分辨率跟踪（Bretscheneider）。。。
¥转录：例如，从成像数据重建转录动力学的工具（兰德）（最近发表的高影响力《公共科学图书馆·生物学》论文的主题）
？基因组学：例如用于聚类的工具（野生）、定位差异基因表达的工具（野）、网络重建的工具（Burroughs，野生）、ChIP-seq分析（Ott）、用于识别时间序列中关键事件的切换工具（Rand，Finkenstadt）。。。
¥蛋白质组学：例如蛋白质结构预测，David Wild是20万英镑赠款的PI，使用统计机器学习分析蛋白质能量学
？其他生物信息学：例如APPLES（Ott）（用于分析调控区和转录因子结合位点的集成工具集）
？模型分析：例如全球敏感性分析的理论包（Rand和Paul Brown）；实验优化包（Rand&Paul Brown）；
我们开发此类工具的能力是我们吸引合作的关键，开发这些工具是我们计划的核心。

有关该中心的更多信息，请咨询David Rand教授(d.a.rand@warwick.ac.uk).

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