systemPipeShiny文档
秒系统P（P）管道S公司希尼（SPS）扩展了广泛使用的系统管道R（SPR）工作流具有通用图形用户界面的环境闪亮的应用程序。这允许非R用户，例如运行许多systemPipeR的工作流设计、控制和交互式可视化功能，无需了解R。最重要的是，SPS系统设计为通用框架，用于以直观的方式与其他R包交互。与大多数闪亮应用程序一样，SPS既可以在本地计算机上使用，也可以在基于服务器的集中式计算机上使用可以作为公共web服务远程访问的部署，以便使用SPR与社区和/或私人数据的功能。该框架可以集成了R/Bioconductor生态系统的许多核心包。以下示例SPS的当前功能包括：
- 默认的交互式工作流模块创建实验设计，使用预览可视化和自定义工作流拓扑，以及在应用程序中编程自由的工作流执行。
- 一个具有广泛绘图选项的交互式模块，用于可视化RNA-Seq工作流的下游分析。
- 一个快速ggplot模块，可从任何用户定义的图中绘制各种科学图表格数据。
- 一组可扩展的可视化功能使其易于设计在SPS框架下自定义Shiny应用程序，而不了解Shiny。
- “Canvas Workbench”用于管理复杂的视觉效果。它允许用户以有效的组合方式组织和比较绘图具有会话截图功能，可编辑科学和可发布的数据。
- 其他三个支持包可帮助初学者和高级开发人员的所有用户在当前SPS框架下或在他们自己的可视化应用程序上进行扩展。
演示
Shinyapps.io演示
查看我们的在线演示应用程序：
对于登录所需的演示，应用程序帐户名为“用户”密码“用户”.
对于管理面板登录，请输入帐户名“管理员”，密码“管理员”.
使用管理员功能时，请不要删除或更改密码。
shinyapp.io公司将偶尔重置应用程序，但这将影响其他人同时尝试演示的人。
Rstudio Cloud演示
有一个Rstudio云项目实例你也可以玩。你需要创建一个免费的新帐户。两个生物导体未安装相关模块-工作流和RNAseq。它们需要超过1GB安装和运行的RAM超出了免费帐户的限制。
码头工人
使用系统管道接收器以获取说明。
系统中的其他软件包PipeShiny
