非局部介质连续体模型的快速解算器

@第{Xie2012AFS条，title={非局部介质连续模型的快速求解}，author={Dexuan Xie和Yi Jiang以及Peter R.Brune和Leighton R.Scott}，期刊={SIAM J.科学计算}，年份={2012}，体积={34}，网址={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:11881347}}
本文基于DOLFIN程序库开发了一种快速有限元算法和Python程序包，使得非局部介质模型的数值求解所需的计算量仅为经典泊松介质模型的两倍。
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26引文

离子溶剂中蛋白质非局部介电模型的有效算法

结果表明，蛋白质在离子溶剂中的非局部介电模型的解是唯一的，可以从求解两个定义明确的偏微分系统和一个类泊松边值问题中找到。

非局部介质模型与非连续介质模型的比较

我们比较了溶质周围电势的局部和非局部介电模型。我们选择一个水分子作为溶质，以便比较能够与散装水的行为相关。…

利用边界积分算子的特征函数展开研究球面几何中的非局部静电

结果表明，非局部溶剂响应可能有助于减少计算pH依赖性蛋白质行为时对非常高介电常数的需要，尽管需要更复杂的非局部模型才能完全解决这个问题。

水球壳包围的球形溶质区域中具有多个电荷的线性非局部泊松-玻耳兹曼方程的解析解。

本文给出了在水球壳包围的球形溶质区域中含有多个电荷的线性非局部泊松-玻耳兹曼方程（NPBE）试验模型的解析解…

离子溶剂中点电荷溶质球非局部介电测试模型的级数解

本文报道了离子溶剂中多点电荷溶质球的非局部介电测试模型的解析解。该解由以下单和级数导出…

非局部Poisson-Boltzmann方程*的分析

提出了一种非线性、非局部介质连续介质模型，称为非局部修正泊松-玻尔兹曼方程（NMPBE），以反映介质的空间频率依赖性…

水中蛋白质的改进非局部连续静电模型及其离子玻恩模型的解析解

非局部连续静电模型，定义为积分微分方程，可以显著改进经典的泊松介电模型，但成本太高，无法应用于大蛋白质…

非局部静电的Trefftz函数

本文针对非局部静电问题发展了Trefftz近似，目的是对原始的非局部问题进行数值“局部化”。

计算生物分子静电的非局部修正泊松-玻耳兹曼方程和有限元求解器

离子溶剂的非局部泊松-费米模型。

我们提出了一个离子溶剂的非局部泊松-费米模型，该模型在静电势的计算中包含了离子尺寸效应和水分子之间的极化相关性。它…

31参考文献

处理溶剂化效应的先进连续介质模型：带空腔的非局部静电

Born–Kirkwood–Onsager（BKO）溶剂化模型，其中溶质分子位于切割成溶剂的空腔内，溶剂被视为介电连续介质，在…

具有振荡磁化率核的非局部连续溶化模型：一个非刚性腔模型

利用具有空间色散的振荡介电函数，应用非局部连续溶剂化理论。发现收敛解不能使用…

非局部静电的新公式。

这项工作提出了一种新的公式，该公式允许在前面提到的应用中产生的非平凡分子几何的数值解，基于引入次级场psi，它充当介电位移场D的无旋转部分的势。

指数磁化率核的非局部连续溶剂化模型

开发了一种算法，用于计算空腔中离子的非局部静电溶剂化理论，考虑静电边界条件。后者意味着…

结构化溶剂中的生物分子：一种新的非局部静电公式及其数值解

水的介电特性的准确建模对于物理、计算化学和分子生物学的许多应用至关重要。原则上，这在…

生物分子模拟中非局部静电的一种新的数值方法

纳米尺度下宏观分子组装体介电响应的连续方程

我们研究了纳米尺度静电场的频率相关连续模型方程。其动机是需要准确地考虑电介质相关性的影响…

化学物理中的连续溶剂化模型：从理论到应用

前言。1.连续体模型的现代理论。1.1物理模型（J.Tomasi）。1.2连续体模型的积分方程方法（E.Cances）。1.3型腔表面及其离散化…

R EVIEW A RTICLE生物物理应用中泊松-玻耳兹曼方程数值方法的最新进展

综述了Poisson-Boltzmann方程边界元方法、界面方法、自适应方法、有限元方法和其他方法以及相关网格生成技术的最新发展。

溶剂结构对蛋白质静电相互作用的影响。

结果表明，考虑到动态溶剂微观结构，蛋白质-固体界面的PEI能量值显著增加。