基于片段的方法现在通常用于药物研究中的铅开发。通常,通过生物化学或生物物理方法,如表面等离子体共振(SPR)、核磁共振(NMR)或热位移分析,预先筛选出一个小而精选的低分子量化合物库;经常被X射线晶体学作为有希望的热门候选。我们设计了一个由364个化合物组成的小片段库,它并不严格遵守通常遵循的Astex三分法的片段库组成规则。[1] 此后,我们的文库在胃蛋白酶样天冬氨酰蛋白酶内毒素胃蛋白酶上进行了验证,该酶作为与疟疾(血浆蛋白酶)、高血压(肾素)和阿尔茨海默病(分泌酶)等严重疾病相关的蛋白质的模型系统,因此是进一步药物开发的有效靶点。由于片段的小尺寸,它们通常只对所应用的靶蛋白表现出低亲和力,因此在任何筛选方法中都很难检测到,这反映在不同筛选方法之间几乎没有重叠。在初步筛选后,我们决定通过X射线晶体学验证整个库,这需要稳定的晶体供应、可重复的浸泡条件和同步加速器源(如HZB BESSY II BL14.1[2])的可靠设置,最好在初始数据处理和细化方面实现一些自动化。获得的总命中率大于10%,将与其他筛选方法的结果进行比较。将讨论由此产生的晶体结构,并为进一步开发铅提供理想的基础。