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外消旋晶体学有助于鉴定DNA序列的结构形式,而这种结构形式以前在对映体当量中没有观察到。

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《水晶学报》。(2022).A类78,e365(电子365)
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六聚体双链d(CGCGCG)的四种高度赝亚面孪晶晶体结构2描述了左旋Z-DNA形式,并与Z-DNA低聚物的其他伪六方晶体结构进行了比较。

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外消旋Z-DNA的晶体结构在中心对称空间群中以0.78º的超高分辨率进行了求解,显示出多重构象的大量存在,不仅在主干上,而且在一些碱基对上。该结构还揭示了新的水合模式和不寻常的双螺旋堆积模式。

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九个包含规范和非规范碱基对的A型DNA 18聚体晶体结构的精细化和验证得益于二核苷酸构象类(NtCs)的使用。

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DNA片段d(AAATATTT)结晶为螺旋排列的长柱状堆叠双工体。柱状物显示晶体中存在伪六角形组织,它们之间没有直接的相互作用。

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两个研究的DNA 18-mers表明溶液中构象的动态平衡,并结晶为具有两个连续T-T错配的双工体。与Watson–Crick配对核苷酸相比,这些不匹配的核苷酸或PDB中发现的其他核苷酸都没有显示出独特的结构特征。

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Runt-domain(RD)蛋白调节靶基因的转录。DNA双链TCTGCGGTC公司/T型GACCGCA公司G、 结合RD转录因子的结合位点(粗体),在空间群中结晶P(P)4对两个晶体进行的X射线分析显示,A-DNA螺旋的两种不同构象,衍射分辨率分别为1.7和2.0º,单位-细胞参数略有变化。

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序列为d的Z-DNA超高分辨率晶体结构(CGCGCG)2显示腐烂(2+)和K的模式+结合。完整的多胺指示在电子密度中可见,并假定其位置允许与三个Z-DNA双工体进行氢键相互作用。K系列+阳离子占据混合K+/H(H)2O位和形成一个不规则的配位球,与水分子和两个Z-DNA分子的两个磷酸基团的O原子相互作用,其中一些配体以分数占有率存在。

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双工d的一种新结构(CGCAATTGCG)2显示了。它含有钴2+衍射至1.6°。所得结果与先前报道的同一双工的四种结构进行了比较。中心六聚体序列CAATTG在所有条件下都具有几乎恒定的构象,而末端碱基对在每种情况下都不同。

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