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《水晶学报》。
(1975).
A类
31
,
698-700
https://doi.org/10.107/S056773947501477
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真实空间中蛋白质坐标的初步细化
R.J.弗莱特里克
和
H.W.威科夫
描述了一个简单的无约束最速下降过程,用于在实际空间中对蛋白质坐标进行初步细化。
通过对核糖核酸酶S的应用说明了该方法。
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《水晶学报》。
(2018).
D类
74
,
531-544
https://doi.org/10.1107/S2059798318006551
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正常开放
接近
中的实际空间细化
菲尼克斯
用于低温电子显微镜和结晶学
P.V.Afonine公司
,
B.K.Poon先生
,
R.J.里德
,
O.V.索博列夫
,
T.C.特威利格
,
A.乌尔珠姆塞夫
和
P·D·亚当斯
描述了在
菲尼克斯·real_space_refine
来自的程序
菲尼克斯
套件及其在重新定义低温EM衍生模型中的应用。
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《水晶学报》。
(2022).
D类
78
,
1451-1468
https://doi.org/10.107/S2059798322010907
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用于实际空间细化的低温电子显微镜和晶体模型图的直接计算
A.G.Urzhumtsev公司
,
L.M.Urzhumtseva先生
和
V.Y.Lunin先生
本文提出了一种新的方法,将有限分辨率和最终非均匀分辨率的映射作为所有原子参数(包括局部分辨率)的解析函数进行计算。
讨论了地图计算的实际细节。
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《水晶学报》。
(2020).
D类
76
,
1184-1191
https://doi.org/10.107/S2059798320013194
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基于Real-space quantum的低温电磁精炼:
问
|
R(右)
#3
L·王
,
H.克鲁斯
,
O.V.索博列夫
,
N.W.莫里亚蒂
,
M.P.沃勒
,
P.V.Afonine公司
和
M.Biczysko先生
基于量子的实空间求精在中的实现
qr.精炼
如所述。
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《水晶学报》。
(1997).
D类
53
,
203-206
https://doi.org/10.107/S090744996012280
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真实空间精细化在蛋白质结构测定中的潜在应用
M.S.查普曼
和
E.布兰科
实空间精化与倒数空间精化交替使用,可以获得比仅在倒数空间中精化更高质量的模型,即使是从基于通常较差的同构替换阶段的映射开始。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
2-13
https://doi.org/10.107/S090744904025697
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实空间蛋白质模型补全:一种逆运动学方法
H.van den Bedem先生
,
一、洛坦
,
J.-C.拉托姆
和
A.M.执事
提出了一种新的算法来自动拟合主链片段与两个锚定残基之间的电子密度。
包括该算法在完成初始蛋白质模型中的应用示例。
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《水晶学报》。
(2023).
B类
79
,
99-100
https://doi.org/10.107/S2052520623002688
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实空间中结构相关性的映射
R.奥斯本
用施密特分析钇稳定氧化锆的中子和x射线漫散射
等。
[
《水晶学报》。
(2023年),B
79
, 137–147
]使用三维成对分布函数(3D-ΔPDF)确定局部结构相关性,而无需复杂建模。
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《水晶学报》。
(2002).
D类
58
,
761-767
https://doi.org/10.107/S090744902003402
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模拟退火实空间精化作为建模工具
A.科罗斯特列夫
,
R.伯特伦
和
M.S.查普曼
实时模拟退火优化是在交互式分子图形包中实现的。
这加快了模型构建的速率限制步骤,提高了后续常规细化的起点和最终质量。
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IUCrJ大学
(2022).
9
,
718-719
https://doi.org/10.1107/S20522522522010466
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正常开放
接近
通过局部分辨率分析模型对实际空间细化和评估的计算图和实验图进行比较时产生涟漪
I.乌森
论文上有评论[
Urzhumtsev和Lunin(2022年)。
IUCrJ大学
,
9
, 728–734
]提出了一种用于静电势体和电子密度图中非均匀分辨率分析建模的新方法,以改进真实空间的精细化。
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《水晶学报》。
(2022).
D类
78
,
136-143
https://doi.org/10.1107/S2059798321012286
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低温环境下的真实空间:未来是局部的
C.M.帕尔默
和
C.H.S.艾利特
展望了低温电子显微镜中真实空间方法的未来发展。
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