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本文报道了两种短的膦酰三肽(两种晶体形式中的一种)的晶体结构,其中含有一种[增量]苯丙氨酸残基,即二甲基(3-{[第三种-但氧羰基甘氨酰-[阿尔法],[测试版]-(Z轴)-脱氢苯丙氨酸]氨基}丙基)膦酸盐,Boc0-甘氨酸1-[增量](Z轴)苯丙氨酸2-[阿尔法]-阿布人事军官2,C21H(H)32N个O(运行)7P、 (I)和二乙基(4-{[第三种-但氧羰基甘氨酰-[阿尔法],[测试版]-(Z轴)-脱氢苯基丙氨酸]氨基}丁基)磷酸酯,Boc0-格莱1-[增量](Z轴)苯丙氨酸2-[阿尔法]-Nva公司人事军官2,作为丙-2-醇单溶剂0.122水合物,C24H(H)38N个O(运行)7P·C公司H(H)8O·0.122小时2O、 (II),乙醇单溶剂化0.076-水,C24H(H)38N个O(运行)7P·C公司2H(H)6O·0.076小时2O、 (三)。(II)和(III)的晶体是同晶的,但溶剂的类型不同。磷酸基团直接连接到最后一个C[阿尔法]所有三种肽的主链中的原子。所有的氨基酸都是反式连接在主链中。晶体结构没有分子内氢键,仅由分子间氢键稳定。

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受保护的三肽苄基N个-{2-[N个-(第三种-丁氧基碳基)脯氨酸]-4-羟基脯氨酸}甘氨酸或Boc-Pro-Hyp-Gly-OBzl,C24H(H)33N个O(运行)7和苄基N个-{2-[N个-(第三种-丁氧基-碳基)-艾伦基]-4-羟基脯氨酸基}甘氨酸盐或Boc-Ala-Hyp-Gly-OBzl,C22H(H)31N个O(运行)7,是胶原蛋白中最小的重复三联体。每个晶体结构中都有两个结构相似的独立肽分子。这些肽相互反平行排列,并通过涉及主链和4-羟基脯氨酸基团的氢键相互作用。这些结构表现出三螺旋的特征,但肽倾向于呈现片状结构。

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在α-和β-C原子之间有C=C键的去氢氨基酸中,氨基酸残基被连接反式并且不存在强的分子内氢键。扭转角表示分子的非螺旋构象。

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包含Boc-Gly-Gly-Phe-X-OMe链的三种受保护四肽的结构,第三种-丁氧羰基-葡萄糖-甘氨酸-苯丙氨酸-亮氨酸甲酯二水合物-L(左)-苯丙氨酸-D类-Leu-OMe,C类25H(H)38N个4O(运行)7·2小时2O、,第三种-丁氧羰基-甘氨酰-甘氨酸-苯丙氨酸-甲硫氨酸甲酯二水合物-L(左)-苯丙氨酸-D类-Met-OMe,C公司24H(H)36N个4O(运行)7第2小时2O和第三种-丁氧羰基-葡萄糖-甘氨酸-苯丙氨酸-亮氨酸甲酯二水合物,Boc-Gly-Gly-D类-苯丙氨酸-L(左)-Nle-OMe,C公司25H(H)38N个4O(运行)7.2小时2O、 描述了。这三个分子具有Boc-Gly-Gly-Phe-X-OMe四肽链的相同构象,并显示出相同的包装,由两个氢(N-H)头尾相连的分子对组成...O) 债券;其他氢键也涉及两个结晶水分子,将这些对连接在一起,形成平面结构。

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两种五脱氢肽的晶体结构比较[三角洲]苯丙氨酸残基,即(Z轴,Z轴)-N个-(第三种-丁氧羰基)甘氨酰-[阿尔法],[测试版]-苯丙氨酸甘氨酰-[阿尔法],[测试版]-苯丙氨酸甘氨酸(或Boc0-格莱1-[增量]Z轴苯丙氨酸2-格莱-[增量]Z轴苯丙氨酸4-格莱5-OH)甲醇溶剂化物,C29H(H)33N个5O(运行)8·中国4O、 (I),和(E类,E类)-N个-(第三种-丁氧羰基)甘氨酰-[α],[测试版]-苯丙氨酸甘氨酰-[阿尔法],[测试版]-苯丙氨酸甘氨酸(或Boc0-格莱1-[三角洲]E类苯丙氨酸2-格莱-[增量]E类苯丙氨酸4-格莱5-OH)、C29H(H)33N个5O(运行)8,(II),表示[增量]Z轴苯丙氨酸残基是折叠结构的更有效诱导剂[增量]E类Phe残留物。扭转角值[瓦尔斐][磅/平方英寸]显示两种III型的存在[测试版]-在[增量]Z轴苯丙氨酸残基和一种II型[测试版]-在[增量]E类Phe残留物。所有氨基酸都是相连的反式在这两种肽中相互连接。[测试版]-肽中的转数由分子内4稳定[向右箭头]1氢键。两种结构中的分子形成平行于(100)平面的二维氢键网络。

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在标题为六肽的分子中,Boc0–甘氨酸1–ΔE类苯丙氨酸2–甘氨酸–甘氨酸4–ΔE类苯丙氨酸5–甘氨酸6–OH、C31H(H)36N个6O(运行)9,有两个重叠的β-匝,其中一个为Δ上的II型匝E类苯丙氨酸2E类Phe是异构体E类α,β-脱氢苯丙氨酸残基)和甘氨酸甘氨酸残基和III′型第二个残基和Gly4残留物。肽中的所有氨基酸都是相连的反式彼此之间。三种相对较强的分子内N-H...氢键稳定晶体结构。其中两个为4→1型,负责肽中的两个β-圈。

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在五肽Boc的晶体结构中0-格莱1–ΔZ轴苯丙氨酸2-格莱–ΔZ轴苯丙氨酸4-格莱5-OMe公司,C公司30H(H)35N个5O(运行)8扭力角Φ和Ψ的值表明在ΔZ轴苯丙氨酸2和Gly残留物和甘氨酸和ΔZ轴苯丙氨酸4残留物。肽中的所有氨基酸都是相连的反式彼此之间。两个分子内N-H...CO和NH基团之间的O氢键稳定肽中的β-圈。

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标题五肽,Boc0-格莱1–ΔZ轴苯丙氨酸2-格莱–ΔE类苯丙氨酸4-格莱5-OMe,C公司30H(H)35N个5O(运行)8·2小时2O、 Δ采用I型β-圈构象Z轴苯丙氨酸2-格莱残留物。它由一个4\右箭头1Δ之间的分子内氢键E类苯丙氨酸4NH和Gly1CO组。五肽序列中的所有氨基酸残基都是相连的反式彼此之间。晶体结构由分子内和分子间氢键稳定。

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第三种-丁氧羰基甘氨酰脱氢丙氨酰甘氨酸甲酯(系统名称:甲基{2-[(第三种-丁氧羰基氨基)-乙酰胺]丙-2-烯酰胺}醋酸酯(Boc0-格莱1-ΔAla2-格莱-OMe)、C13H(H)21N个O(运行)6已通过单晶X射线衍射和密度泛函理论(DFT)计算在B3LYP/6–311+G**水平上进行了结构表征。固态和计算结构中的肽链既不采用β圈,也不采用γ圈。三肽序列中的所有氨基酸残基都是相连的反式彼此之间。晶体结构和气相中氨基酸单元的键长和价角是可比较的。然而,第三个甘氨酰残基(Gly)的构象)在结晶状态和气相中是不同的。通过Gly之间额外的分子内短接触使其在计算结构中稳定NH和甲酯COMe基团。

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在本研究中,我们报道了五肽Boc-Tyr的X射线衍射分析-D类-Ala-Gly-(NMe-Phe)-(Met-O-Me),C35H(H)49N个5O(运行)9S·1.125小时2O.这是甲基苯甲胺(LY127623)、酪氨酸溶液相合成中的受保护中间体-D类-Ala-Gly-NMe-Phe-Met-NH2。肽在单斜空间群中结晶C2,在不对称单元中具有两个肽摩尔和三个溶剂(水)摩尔。该肽具有类似于其他肽的延伸构象遇见-脑啡肽。

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