八聚体d（GTGTACAC）的六方晶型在精胺存在下生长，具有单位-细胞尺寸一=b条=32.18和c（c）=78.51Ω，空间组P（P）6122，在不对称单元中有一条DNA链。从早期的低分辨率模型开始，并使用Siemens-Xentronics面积探测器在258 K下收集的高分辨率1.4º数据，对结构进行了改进。共有4365个独特的反射大于2σ(F类)分辨率范围为5–1.4º。模型被改装成3个F类o个− 2F类c（c）使用了模拟加权省略图和差异图来定位水分子。最终的模型包含161个DNA原子和37个水分子，给出了一个R（右）因子为19.8%。同样八聚体的晶体也在亚精胺而非精胺的存在下生长，并使用标称1.45？分辨率数据、3292独特反射、最终R（右）=19.1%，给出了几乎相同的DNA参数。在这两种结构分析中均未检测到结合精胺或亚精胺。DNA的电子密度很清楚，在六元碱基环的中心和一些糖环的中心都有孔。高分辨率结构提供了更精确的DNA参数，并证实了早期2Å研究中观察到的特征，包括C（3′）的A7（A15）糖团中的堆积诱导畸变-内幕和C（2′）-内幕这一变化导致端基对偏离螺旋轴弯曲，而双工的其余部分几乎呈线性。表征了深槽和浅槽中的水合模式。发现了水分子链，但没有环。已经分析了对称相关双链的末端碱基对和小凹槽之间常见的分子间接触区域，该区域涉及一条链上的四个残基和另一条链上的两个残基。其中一种相互作用是氢键。
