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从X射线衍射数据中导出的热运动参数的常规分析可以扩展到包括某些特定内部分子运动的影响。

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扩散散射是由蛋白质晶体中的相关运动引起的,是蛋白质动力学信息的潜在来源。虽然在早期的研究中,内部运动模型能够在有限的程度上再现漫反射散射,但这里显示,迄今为止,最主要的贡献来自刚体平移,内部运动仅占总散射的一小部分。尽管有这些发现,但仍讨论了提取内部运动信息的可能性。

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谐波热参数的刚性键条件表明,原子的均方位移差A类B类沿着共价键A类-B类可以忽略不计。本文将非键分子内距离的相应条件称为刚性连接。根据TLS公司形式主义要求所有分子内的连接都是刚性的。相反,一组刚体连杆并不一定等同于刚体运动。提出了一种确定最大数的算法N个独立刚性连杆的N个-原子分子。一般来说,对于场地对称性1,N个=N个-1代表线性,3代表线性N个-平面分子为6。对于三维分子,N个=N个(N个- 1)/2,N个≤8和6N个-20,N个≥ 8. 对于特定的几何图形,N个可能更小。对于许多分子,N个刚性连杆相当于刚体运动。值得注意的例外是大多数线性和平面分子,以及所有具有六个或七个原子的分子。较高的位置对称性减少并通常消除刚性连杆和刚体运动之间的这些差异。建议在晶体学最小二乘法中使用刚性约束。它们提供了一种计算简单的方法,通过TLS公司任何分子位置对称性的模型。

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这个-研究了100-300K温度范围内二硝基苯的晶体结构和热膨胀,并对其各向异性位移参数进行了刚体分析。从头算计算评估了振动对分子静态一阶超极化率的贡献。

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“非刚性”谐波晶格动力学模型已用于计算o(o)-三联苯。为此,采用了由一系列其他芳香烃导出的经验内力场和外力场。计算的各向异性温度因子与相应的中子衍射数据之间的一致性很好(10%);如果在我们的模型中忽略分子内范德华相互作用,情况会变得更糟。对非刚性热运动的一般情况进行了键长修正:对于C-H键,与“普通”刚体模型的差异尤其明显。

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以原子分辨率测定了正交型木聚糖酶II的晶体结构,并通过分析各向异性位移参数评估了其结构起伏。

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均方位移张量的晶格动力学计算W公司对于非刚性分子来说,只要已知合适的势,在谐波近似中就不是一个困难的问题;从中可以很容易地导出键长校正的基本信息。对称变换和场地对称要求W公司根据群论进行讨论:对于刚体,它们符合以下要求T型,L(左)S公司.

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根据单晶X射线衍射数据,测定了两种二硝基双胍的热膨胀张量和主要结构参数在85-298K温度范围内的温度变化。使用平动张量和平移张量对相同范围内的分子热运动进行了刚体分析。

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提出了一种估算氢原子各向异性位移参数的新方法和新程序。根据分子轨道计算和中子衍射数据验证了结果。

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研究了95-300K范围内4-异丙基苯酚的晶体结构、热膨胀和各向异性位移参数的刚体分析。

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