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TRIM-蛋白环结构域通常存在于弱单体-二聚体结合中;在这里,TRIM69的环结构域形成了一个紧密的二聚体,并且该结构被用来讨论这种高亲和力相互作用的原因。

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TRIM-蛋白环结构域通常存在于弱单体-二聚体结合中;在这里,TRIM69的环结构域形成了一个紧密的二聚体,并且该结构被用来讨论这种高亲和力相互作用的原因。

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人类TRIM NHL结构域的全家族结构分析揭示了其β-推进器结构的进化差异,这可能对招募不同的相互作用伙伴以及NHL结构区作为E3连接酶的作用至关重要。

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三部分基序(TRIM)蛋白是一个由100多个成员组成的大家族,其中一些在抗病毒免疫和先天免疫信号传递中起重要作用。TRIM5α与进入的HIV-1衣壳相关,干扰受控的分解,并通过蛋白酶体将其靶向降解。TRIM21是一种细胞溶质抗体受体,也针对进入的病毒衣壳进行蛋白酶体降解。TRIM25还参与先天免疫,对RIG-I的泛素化至关重要。最近的阳性选择分析预测了另外10种具有抗病毒活性的TRIM蛋白。尽管TRIM5α、21和25在抗病毒保护中发挥关键作用,但其作用机制尚不完全清楚。所有三种蛋白质都具有相似的结构域结构,包括一个环、B盒、螺旋线圈和PRYSPRY结构域。RING结构域负责泛素连接酶活性,而PRYSPRY结构域决定靶向特异性。我们将晶体学和SAXS相结合,生成了第一个完整的TRIM蛋白质结构模型。TRIM25的晶体学研究揭示了一个中心细长的卷曲-线圈结构域,具有不寻常的右手扭转。由卷曲线圈形成的二聚体是反平行的,但随后是反转蛋白质链方向的额外螺旋。这种结构表明,每个单体的N端结构域是分离的,但C端结构域保持接近。多角度光散射(MALS)、等温滴定量热法(ITC)和SAXS分析证实溶液中存在这种二聚体结构。此外,对TRIM21的三部分基序(包括环、B盒和线圈)的散射研究表明,每个单体的前两个域相隔150-200Ω。最后,SAXS测量完整TRIM21及其配体IgG Fc之间的复合物,提供了完整TRIM蛋白的第一个经验结构。

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三部分基序包含蛋白2(TRIM2)作为E3泛素连接酶发挥作用。属于空间群的TRIM2的NHL结构域的晶体结构P(P)21,带有单位-细胞参数= 43.6,b条=76.4,c(c)已确定=107.4º、α=90.0、β=94.0和γ=90.0°。

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《水晶学报》。(2017年)。A类73,C539元
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Parkin是一种E3泛素连接酶,负责一些常染色体隐性形式的帕金森氏病。尽管parkin是一种RING型E3连接酶,但它的活性使用混合的RING/HECT机制。parkin全长的晶体结构和RING0-RING1-In-Betreen-RING-RING2模块揭示了parkin的构象,其中E2结合位点距离泛素转移的催化半胱氨酸太远[1]。许多分子内相互作用发生在不同的RING结构域之间,以及与阻遏因子的相互作用,RING0是parkin所特有的。参与这些相互作用的残基突变导致parkin活性增加。这表明帕金在基础状态下采用了自动抑制状态。因此,在应激反应条件下,parkin需要进行分子重排,通过翻译后修饰和/或与其他蛋白质的相互作用进行调节,才能发挥活性。Pink1对parkin的Ubl结构域中丝氨酸65进行磷酸化,Pink1是一种在一些帕金森病患者中也发现突变的激酶,显示出增加parkin活性。最近的出版物表明,泛素也被Pink1磷酸化,而且磷酸化的泛素可以激活parkin[2,3]。我们使用了不同的结构生物学和蛋白质相互作用技术来进一步表征磷酸化泛素与帕金的相互作用。这项工作为帕金活化和导致帕金森病的机制提供了深入的见解。

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