虽然获得性免疫系统的显著特异性已被明确证明，但免疫识别中的退化特异性经常被观察到。我们已经开始使用肽和糖作为模型系统研究抗体的退化特异性。糖类抗原（me-α-Man）和肽（DVFYPYPYASGS）在多克隆和单克隆抗体（2D10）反应中都是等效的（1）。Ag-Ab相互作用的热力学分析表明了构象柔性的作用（2），而晶体学分析表明了可塑性在抗原结合位点相互作用（3）中的重要性，这是分子模拟的表现。有人指出，即使存在灵活性的潜力，但在识别这两种配体时也没有加以利用。因此，为了解决这个难题，我们开始寻找其他糖和肽，它们可以与具有类似亲和力的单抗2D10结合。对2D10与五种不同糖（me-α-Glc、α-Lac、α1-3-Manobiose、α1-6-甘露糖、α1-3、α1-6-Mannotriose）结合的结晶分析为分子识别的特异性基础提供了依据。所有结构的比较表明，糖的抗原结合位点仅由CDR H3、L1和L3组成。所有五种糖都有一个重叠的初级结合位点（相当于me-α-Man相互作用区域）。该主要糖结合位点已被证明通过利用抗原结合位点中可用的相互作用残基的可塑性来容纳相似和不同的糖。类似二糖（α1-3-甘露糖、α1-6-甘露糖）的还原糖已按相同方向调整，但使用了抗体副肽的不同组相互作用残基。然而，不同双糖（α-Lac）的还原糖共同利用不同的副视空间。三糖（α1-3，α1-6-Mannotriose）通过利用副镜区（主要在CDR L1）的构象灵活性被调节在同一位置。这项研究表明，亲和力成熟的抗体可以利用至少三种不同的策略来适应结构相似/不同的糖。
