结构生物信息学的抽象、算法和数据结构PyCogent公司

M.Cieslik先生,Z.S.德雷温达和C.穆拉

蛋白质结构分析的灵活抽象、算法和数据结构已经开发并集成到PyCogent公司生物信息学软件，从而扩展了基于序列的工具包的范围，以实现基于序列/结构的组合生物信息学研究。

PSAP公司：蛋白质结构分析包

B.巴拉穆鲁根,M.N.A.Md.罗山,B.沙胡尔·哈米德,K.Sumathi公司,R.森蒂尔库马尔,A.乌达亚库马尔,K.H.Venkatesh巴布,M.卡拉瓦尼,G.Sowmiya公司,P.西瓦桑卡里,S.萨拉瓦南,C.瓦苏基·兰贾尼,K.戈帕拉克里什南,K.N.塞尔瓦库马,M.贾库马尔,T.布林达,D.迈克尔和K.塞卡尔

已经开发出一个互联网计算引擎来分析三维蛋白质分子。

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CCP-FEL：自由电子激光研究的计算机程序集

F.R.N.C.玛雅,T.A.白色,N.D.Loh公司和J.哈伊杜

最新虚拟专刊应用晶体学杂志(//journals.iucr.org/special_issues/2016/ccpfel杂志)介绍了自由电子激光研究中一系列主题的工具，如实验模拟、数据采集的在线监测、点击选择、数据质量诊断、数据管理、数据分析和纳米晶和单粒子衍射成像的结构确定。

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伊利诺伊州：一套蛋白质晶体结构解的计算机程序

M.C.伯拉,R.卡利安德罗,M.卡马利,B.卡罗齐尼,G.L.卡斯卡拉诺,L.De Caro公司,C.贾科瓦佐,G.波利多里,D.西里奇和R.斯帕尼亚

计算机程序集的主要特点和潜力伊米廖尼描述了。

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达吉斯特：一套用于模式匹配、空间群测定和粉末衍射数据强度提取的计算机程序

O.Vallcorba公司,J.赖斯,C.前沿,一、Peral和C.米拉维特列斯

交互式粉末衍射程序达吉斯特对于全图匹配，描述了空间群确定和积分强度提取。生成的强度数据文件与XLENS公司（Patterson函数直接法）和TALP公司作者实验室（ICMAB，CSIC）的（直接空间多解方法）程序。

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福瑞尔2D和福瑞尔3D：在晶体学中演示傅里叶合成的程序

A.M.格雷泽

为了教学目的，使用两个简单的计算机程序演示了傅里叶合成。

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更换，一套用于分子置换计算的计算机程序

L.Tong先生

一套计算机程序(更换)发展了用分子置换法测定晶体结构的方法。它目前包括一个通用（锁定）旋转功能程序(GLRF公司)和翻译功能程序(TF公司). 旋转功能程序可以执行普通的以及锁定的自旋转或交叉旋转功能计算。它还可以基于与非晶态对称性相关的亚基的最大电子密度重叠来优化非晶态的对称性参数。翻译搜索可以基于R（右）-因子、相关系数、Patterson相关和电子密度相关准则。也可以检查单位细胞中分子结构的堆积情况。

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粉末衍射图形自动分析的两个计算机程序

S.M.克拉克

达斯伯里实验室同步辐射源的实时粉末衍射研究每天产生数百种粉末衍射图案。已经开发了计算机程序，用于通过对每个图案的选定范围进行多峰值拟合和全图案拟合，将这些图案自动还原为峰值参数列表。

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如何使用生物信息学工具充分利用我的蛋白质序列？

J.佩雷拉和V.阿尔瓦

描述了用于蛋白质序列注释的生物信息学工具，主要是通过MPI生物信息学工具包提供的工具。这些包括用于鉴定已知结构的同源物、蛋白质结构域、序列重复、卷曲线圈、跨膜片段和信号序列的工具。

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摩尔体积：一个易于使用的程序，用于分析化学结构的空腔、体积和表面积

J.B.马格里奇和R.拉文多姆

摩尔体积是一个计算分子及其空腔的体积和表面积的自由程序。

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