已经组装了一个程序包，用于分析Brookhaven蛋白质数据库（PDB）格式的蛋白质坐标。这些程序可用于生成两种类型的φ——ψplots：一个Ramachandran风格的散点图和一个φ和ψ值作为线性序列的函数。程序也可用于显示蛋白质的距离对角线图。可以比较两种蛋白质结构，并将结构中产生的r.m.s.差异绘制为序列的函数。温度因素可以作为线性序列的函数进行分析和绘制。此外，还提供了各种实用程序，用于将包含多个子单元的PDB文件拆分为单个文件，以及对PDB文件进行重新编号。还提供了一个实用程序，用于将Amber样式的PDB文件转换为标准PDB文件。牧师的计划色带[J.应用。克里斯特. (1988),21，572–576]已转换为在独立模式下运行，并对三维带状图像进行交互式旋转。程序为Silicon Graphics四维级别，已在4D70/GT和个人Iris工作站上测试，尽管提供Postscript输出的程序已转换为在Digital Equipment Corporation VAX计算机和Sun工作站上运行。
