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《水晶学报》。
(2020).
D类
76
,
9-18
https://doi.org/10.107/S2059798319015468
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接近
我们离通过分子置换技术实现自动晶体结构解决方案还有多远?
M.C.伯拉
,
B.卡罗齐尼
,
G.L.卡斯卡拉诺
,
C.贾科瓦佐
和
G.波利多里
描述了一种基于分子置换相的蛋白质和DNA/RNA分子的自动晶体结构溶液的自动流水线。
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《水晶学报》。
(2021).
D类
77
,
1602-1613
https://doi.org/10.107/S2059798321010937
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走向核酸的自动晶体结构解决方案:使用新的
驾驶室
程序
G.L.卡斯卡拉诺
和
C.贾科瓦佐
新的
驾驶室
描述了自动建模程序,并与其他自动建模技术进行了比较。
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《水晶学报》。
(2022).
D类
78
,
1090-1098
https://doi.org/10.107/S2059798322007732
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ModelCraft公司
:先进的自动建模管道,使用
海盗
P.S.债券
和
K.D.Cowtan公司
ModelCraft公司
是一种新的建模管道,它是对以前管道的改进
海盗
通过添加新的步骤,使其更有可能建立一个完整的蛋白质模型,特别是当从较差的分子替代溶液开始时。
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
2174-2185
https://doi.org/10.107/S090744913013218
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通过分子替换解决核酸结构:来自第二组内含子研究的例子
马西娅先生
,
E.汉弗莱斯·纳拉亚南
,
K·S·基廷
,
S.Somarowthu公司
,
K.Rajashankar
和
A.M.派尔
通过分子替换实现核酸结构阶段化的策略,使用实验和
从头开始的
对设计的模型进行了讨论。
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
1856-1863
https://doi.org/10.1107/S139004715012730
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分子置换程序的进展:
REVAN公司
管道
B.卡罗齐尼
,
G.L.卡斯卡拉诺
,
C.贾科瓦佐
和
A.马佐尼
这个
REVAN公司
蛋白质晶体结构自动解决方案流水线
通过
介绍了分子替换和密度引导优化算法。
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(2011).
一个
67
,
1-8
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具有自动构建潜力的核酸的几何性质
T.格鲁尼
和
G.M.谢尔德里克
描述了在实验电子密度中自动构建核酸的算法和几何特性。
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《水晶学报》。
(2021).
D类
77
,
457-462
https://doi.org/10.107/S2059798321001765
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通过自动建模和侧链匹配从电子冷冻显微镜图中识别蛋白质
T.C.特威利格
,
O.V.索博列夫
,
P.V.Afonine公司
,
P.D.亚当斯
,
C.-M.Ho先生
,
十、李
和
Z.H.Zhou先生
提出了一种基于自动建模和序列分配的电子冷冻显微术图谱中蛋白质识别方法。
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《水晶学报》。
(2012).
D类
68
,
391-403
https://doi.org/10.107/S09074491104978X
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DEN精细化和自动模型构建在一个困难的分子重定位阶段中的应用:来自
谷氨酸棒杆菌
A.T.Brunger公司
,
D.达斯
,
A.M.执事
,
J.格兰特
,
T.C.特威利格
,
R.J.阅读
,
P.D.亚当斯
,
M.莱维特
和
G.F.施罗德
DEN细化和自动化模型构建
自动编译
用于测定推测的琥珀酰基二氨基庚二酸去琥珀酰酶的结构
C.谷氨酸
这种分子置换阶段化的困难情况表明,DEN细化和
自动编译
优于标准优化协议。
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《水晶学报》。
(2009).
D类
65
,
477-484
https://doi.org/10.107/S090744909008609
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EDM-DEDM和蛋白质晶体结构解决方案
R.卡利安德罗
,
B.卡罗齐尼
,
G.L.卡斯卡拉诺
,
C.贾科瓦佐
,
A.M.Mazzone公司
和
D.斯利奇
EDM-DEDM程序已与自动化模型构建程序集成。
正确的蛋白质模型是从由
从头算
SAD/MAD和分子置换技术。
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《水晶学报》。
(2006).
D类
62
,
146-150
https://doi.org/10.107/S090744905035365
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多组分晶体中核酸和蛋白质的荧光检测
H.凯滕伯格
和
P.克拉默
描述了一种高灵敏度和特异性的基于荧光的快速检测大分子复合物晶体中核酸的方法。
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