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描述了一个计算机程序,用于帮助可视化和表征大分子晶体中的溶剂通道。

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这项研究报告了通过扩散(浸泡)到宿主蛋白质晶体的溶剂通道中掺入小客体蛋白质,通过显微镜技术在时间和空间上进行可视化。这些结果是实现基于蛋白质的晶体宿主(“hostal”)系统的第一步,该系统可能在未来用作蛋白质来宾和/或来宾蛋白质结构测定的载体/夹带系统。

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提出了一种计算溶剂通道及其瓶颈的新工具,特别强调了小分子浸泡。介绍了PDB中所有晶体结构的瓶颈半径以及成功浸泡结构的手工数据集。

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最新虚拟专刊应用晶体学杂志(//journals.iucr.org/special_issues/2016/ccpfel杂志)介绍了自由电子激光研究中一系列主题的工具,如实验模拟、数据采集的在线监测、点击选择、数据质量诊断、数据管理、数据分析和纳米晶和单粒子衍射成像的结构确定。

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平均而言,母液或溶剂及其成分约占大分子晶体的50%。在建模和精化中,需要准确考虑有序和无序的溶剂组分,通常具有相当大的复杂性。

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为了教学目的,使用两个简单的计算机程序演示了傅里叶合成。

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交互式粉末衍射程序达吉斯特对于全图匹配,描述了空间群确定和积分强度提取。生成的强度数据文件与XLENS公司(Patterson函数直接法)和TALP公司作者实验室(ICMAB,CSIC)的(直接空间多解方法)程序。

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对于几种不同的蛋白质晶体,100K下的气流冷却比77K下的液态氮冷却产生的镶嵌性更低。

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