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《水晶学报》。
(2013).
如果
69
,
284-287
https://doi.org/10.107/S1744309113002467
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来自
日本鞘翅目
UT26型
O.Degtjarik先生
,
查洛普科娃
,
P.雷扎科娃
,
M.库蒂
,
J.丹博斯基
和
I.库塔·斯马塔诺娃
为了研究酶的功能,构建了两个携带单点和双点突变的卤代烷烃脱卤酶变体LinB32和LinB70,并在不同的结晶条件下结晶。
LinB变体及其与卤化底物的配合物的衍射分辨率为1.6至2.8º。
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《水晶学报》。
(1999).
D类
55
,
1231-1233
https://doi.org/10.107/S09074499900459X
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卤代烷烃脱卤酶LinB的结晶和初步X射线衍射分析
少动鞘氨醇单胞菌
UT26型
I.斯马塔诺娃
,
Y.Nagata(永田)
,
L.A.Svensson公司
,
高木先生
和
J.马雷克
水解卤代烷脱卤酶
少运动链球菌
UT26采用PEG 6000作为沉淀剂,通过蒸汽扩散法结晶。
在低温条件下,自然衍射数据的分辨率为1.6º。
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1231-1233
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卤代烷脱卤酶LinB的结晶及初步X射线衍射分析
少动鞘氨醇单胞菌
UT26型
I.斯马塔诺娃
,
Y.Nagata(永田)
,
L.A.Svensson公司
,
高木先生
和
J.马雷克
水解卤代烷脱卤酶
少动链球菌
UT26采用PEG 6000作为沉淀剂,通过蒸汽扩散法结晶。
在低温条件下收集到1.6Å分辨率的原生衍射数据。
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《水晶学报》。
(2021).
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77
,
347-356
https://doi.org/10.107/S2059798321000486
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新型卤代烷脱卤酶DpaA的四聚体结构
伞形肺吸虫
二氧化氮
A.迷宫
,
T.普鲁德尼科娃
,
P.格林科维奇
,
J.R.梅斯特斯
,
D.姆拉佐娃
,
查洛普科娃
,
J.丹博斯基
,
M.库蒂
,
P.科伦科
和
I.库塔·斯马塔诺娃
来自的DpaA
琼脂拟杆菌
NO2是一种新型的卤代烷脱卤酶,已被成功纯化和结晶。
基于本文报道的晶体学数据的DpaA模型提供了卤代烷脱卤酶亚家族I中四聚体结构的第一个例子。
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新型卤代烷脱卤酶DpaA的四聚体结构
伞形肺吸虫
二氧化氮
A.迷宫
,
T.普鲁德尼科娃
,
P.格林科维奇
,
J.R.梅斯特斯
,
D.姆拉佐娃
,
查洛普科娃
,
J.丹博斯基
,
M.库蒂
,
P.科伦科
和
I.库塔·斯马塔诺娃
来自的DpaA
琼脂拟杆菌
NO2是一种新型的卤代烷脱卤酶,已被成功纯化和结晶。
基于本文报道的晶体学数据的DpaA模型提供了卤代烷脱卤酶亚家族I中四聚体结构的第一个例子。
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《水晶学报》。
(2023年)。
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79
,
956-970
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正常开放
接近
不典型的同二聚体反应由(
S公司
)-对映选择性卤代烷脱卤酶DmmarA
海洋分枝杆菌
K.斯纳杰达洛娃
,
S.M.马克斯
,
J.丹博斯基
,
D.贝德纳尔
和
马雷克先生
晶体结构(
S公司
)-来自水性致病微生物的对映选择性卤代烷脱卤酶DmmarA
海洋分枝杆菌
以1.6和1.85º的分辨率测定。
这些结构揭示了一种以前未观察到的同源二聚模式,主要通过不寻常的L5-L5环相互作用介导。
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不典型的同二聚体反应由(
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)-对映选择性卤代烷脱卤酶DmmarA
海洋分枝杆菌
K.斯纳杰达洛娃
,
S.M.马克斯
,
J.丹博斯基
,
D.贝德纳尔
和
马雷克先生
晶体结构(
S公司
)-来自水性致病微生物的对映选择性卤代烷脱卤酶DmmarA
海洋分枝杆菌
以1.6和1.85º的分辨率测定。
这些结构揭示了一种以前未观察到的同源二聚模式,主要通过不寻常的L5-L5环相互作用介导。
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(2014).
D类
70
,
209-217
https://doi.org/10.107/S1399004713026254
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卤代烷脱卤酶DhaA31降解1,2,3-三氯丙烷的结晶分析
M.拉霍达
,
J.R.梅斯特斯
,
A.Stsiapanava公司
,
查洛普科娃
,
M.库蒂
,
J.丹博斯基
和
I.库塔·斯马塔诺娃
晶体的蒸汽浸泡
红色R
卤代烷脱卤酶变体DhaA31与1,2,3-三氯丙烷在室温和pH 6.5条件下促进了蛋白质底物复合物的产生。
将无底物的DhaA31结构与DhaA31-底物络合物的结构进行比较,揭示了亲核残基Asp106的两种可选构象和卤化物释放的可能途径,而将DhaA31DhaA与野生型DhaA进行比较,则揭示了活性位点的尺寸减小和溶剂可及性。
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卤代烷脱卤酶DhaA31降解1,2,3-三氯丙烷的结晶分析
M.拉霍达
,
J.R.梅斯特斯
,
A.Stsiapanava公司
,
查洛普科娃
,
M.库蒂
,
J.丹博斯基
和
I.库塔·斯马塔诺娃
晶体的蒸汽浸泡
红色R
卤代烷脱卤酶变体DhaA31与1,2,3-三氯丙烷在室温和pH 6.5条件下促进了蛋白质底物复合物的产生。
将无底物的DhaA31结构与DhaA31-底物络合物的结构进行比较,揭示了亲核残基Asp106的两种可选构象和卤化物释放的可能途径,而将DhaA31DhaA与野生型DhaA进行比较,则揭示了活性位点的尺寸减小和溶剂可及性。
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《水晶学报》。
(2019).
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75
,
324-331
https://doi.org/10.107/S2053230X19002796
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冷适应卤代烷脱卤酶DpcA的晶体结构
嗜冷核菌
K5公司
K.Tratsiak公司
,
T.普鲁德尼科娃
,
I.德里诺夫斯卡
,
J.丹博斯基
,
J.布林达
,
P.帕科尔
,
M.库蒂
,
查洛普科娃
,
P.雷扎科娃
和
I.库塔·斯马塔诺娃
嗜冷细菌卤代烷脱卤酶DpcA的结构
嗜冷核菌
K5是一种生物技术应用中很有吸引力的酶,其原子分辨率为1.05 Au。
与其他卤代烷脱卤酶相比,该酶具有最短的主通道和狭缝通道。
结构比较显示了帽状结构域α4螺旋区域的主要差异,这是隧道特性的决定因素之一。
DpcA的结构信息为理解其催化特性奠定了基础,并可以指导这种冷适应酶的修饰以用于各种生物技术应用。
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