用直接方法以非原子分辨率求解蛋白质

一个新的三重不变公式被用于相位从头算具有非原子分辨率数据的蛋白质。

用直接方法以非原子分辨率解决蛋白质：更新

相位细化程序从头算描述了重原子的结构解。

重新审视了直接方法技术，并描述了新的数学方法。

一个用于数学软件已开发，包含最重要的点和空间群信息以及各种光子-原子相互作用的表格。它包括处理晶体学数据的基本功能以及计算与晶体学和X射线衍射有关的各种量的程序。

Python是科学计算中最流行的编程语言之一。本文介绍了如何使用专用库和并行计算来解决晶体学问题，从而实现高性能。

描述了应用于原子分辨率以下蛋白质衍射数据的直接方法。详细给出了SAD阶段化、模型完成和阶段扩展的典型示例。

按时间顺序回顾了模式函数直接法，并描述了它们在粉末和电子衍射中的应用。

我们提出了一种基于直接方法的双空间迭代策略，用于使用预测模型完成分子替换（MR）的模型。直接方法已被证明是蛋白质晶体学中相位优化的有力工具，而双空间迭代策略特别适用于从一个小亚基开始求解晶体学蛋白质复杂结构。这种组合方法为简化MR预测模型的预处理步骤和最终模型完成提供了捷径。

直接方法定相的“摇晃和烘烤”程序的微小变化可以将成功应用的最小分辨率从1.2Å扩展到1.5Å。这些变化还允许解决大分子结构，这是以前用这些方法解决的大分子结构的两倍。

代数分析得出了塞尔方程和切线公式的体积-固体修正形式，并通过分子量约为100和150 kDa的两种蛋白质结构的经验数值计算进行了验证。

搜索IUCr日志		国防部		高级搜索
作者		体积	第页