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成功地预测了苯和萘在常压和高压条件下的晶体结构。使用基于增强分子动力学的取样,我们发现混合结构在高压下这些化合物的固态形式中普遍存在,而标准晶体结构预测方法通常无法发现混合结构。

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通过分子动力学模拟研究了鳞石英的多晶结构变化。再现了主要的多态性转变,并解释了其机制。

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原子模拟增强了蛋白质晶体学,对参与调节基本生物过程(包括新陈代谢、发育、记忆和免疫反应)的蛋白激酶产生了机制性见解。

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给出了萘的真实分子动力学计算,并将模拟结果与晶体学数据进行了比较。分子动力学样品由4096个分子组成,以循环边界条件排列在一个体积中,每个分子与ICL DAP计算机的一个处理元件相关联。所使用的势函数与晶格动力学所用的势函数相同,是从原子-原子6-exp函数发展而来的。与晶格动力学结果的比较证明了程序的正确性。温度是以通常的分子动力学方式引入的,从而实现了非简谐行为的真实建模。计算始终在零压力下进行,得出晶体单元的温度变化、平均分子取向和刚体热振动张量T型L(左)这些结果与最近报道的粉末样品中子散射测量结果进行了比较,并通过约束细化进行了分析。单位体积随温度的变化与实验结果特别接近,尽管在涉及分子取向行为的测量中差异开始显著。

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结晶过程以激活事件为特征,因此应用了强化采样技术,如元动力学,以便通过分子模型研究分子尺度上发生的现象。本文介绍了超动力学及其在晶体成核方面的应用。

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对核磁共振晶体学领域中完全自动生成的定制力场的性能进行了评估,并与现有基准进行了比较。本研究揭示了运动平均核磁共振晶体学的优点和局限性。

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这项工作介绍了一个交互式开放教育资源,旨在向弹性散射技术的用户介绍经典分子动力学模拟,并展示如何使用模拟为实验分析提供信息。

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给出了的概念证明CLP-动态,一种自由分子动力学工具,用于可靠模拟凝聚相中的有机分子。

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在μ-Al等复杂合金中观察到的堆叠图案4通过分子动力学模拟研究了Mn相。

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本文介绍了金纳米粒子的分子动力学模拟结果,并通过X射线衍射对其进行了实验验证。所进行的研究表明,金纳米团簇中的结构无序与表面效应和空位有关。

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