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麻疹病毒(MeV)磷蛋白(P)多聚化结构域(PMD)的各种构建体的结构表征揭示了由于晶体约束和这种卷曲线圈的柔性性质,四元结构中的显著差异。事实上,尽管有一个保守的四聚体平行卷曲线圈核心,但结构比较揭示了C末端末端的显著变形,甚至导致卷曲线圈的部分展开。这些变形是由晶体内的分子间相互作用以及结晶条件引起的。这些变形也表明PMD具有适应外部机械约束的能力。我们结合生物物理方法(尺寸排除色谱法、圆二色性和小角度X射线散射)评估了MeV PMD C末端区域在溶液中的差异柔韧性。综上所述,这些结果表明,晶体包装可用于在特定状态下“冷冻”蛋白质,即已知处于动态折叠平衡的蛋白质部分。他们还意识到,基于对已知动态蛋白质单晶结构的分析得出的关于功能和机制的结论很容易产生偏差,他们在一定程度上挑战了可以从氨基酸序列可靠预测线圈结构的假设。

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在细菌中,高亲和力锌输入是由ATP-结合盒(ABC)转运蛋白完成的,该转运蛋白依赖细胞外溶质结合蛋白(SBP)获取金属并将其传递到膜透性酶。锌结合(holo)形式的晶体结构柯氏柠檬酸杆菌已测定SBP ZnuA。尽管与ZnuA同源物的序列一致性为95%肠道沙门菌,科塞里CZnuA表现出不同的锌配位和闭合而非开放构象。与其他紧密的ZnuA同源结构的比较表明,灵活的构象景观可能对锌结合和/或传递到渗透酶很重要。

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蝙蝠类干扰素刺激基因产物15(ISG15)的结构达维迪先生被阐明为1.37º分辨率。来源于中国特有蝙蝠物种的ISG15与来自小鼠和人类的ISG15的结构比较揭示了ISG15的泛素样结构域之间保守的疏水界面。利用等温滴定量热法探讨了这种相互作用对木瓜蛋白酶样病毒脱ISGylase与ISG15结合的影响。

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框架材料具有固有的灵活性,可以通过几何模拟进行研究。我们综述了能量材料中的骨架柔性特性,并给出了含有18-冠-6醚作为结构导向剂的EMT沸石骨架柔性窗口的新结果。

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丝氨酸消旋酶(SR)是一种依赖PLP的酶,可转化-丝氨酸到D类-丝氨酸。答1.9介绍了具有两点突变的人SR全酶(Cys2Asp、Cys6Asp)的?分辨率晶体结构,并通过与其他全结构和配体结合SR结构的比较,分析了二级结构和三级结构元素,以重新定义小域内的域边界、结构排列和亚域运动。

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的C末端域的结构扎伊尔埃博拉夫病毒核蛋白(NP)包含641-739残基,以两种不同的晶体形式测定。该结构域有一个新的折叠,与β-抓握折叠有远亲关系。

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分析了SARS-CoV-2尖峰在预融合状态下的灵活性和构象动力学。获得了一个最小偏差的系综图,揭示了受体结合域(RBD)、N末端域以及先前表征的1-RBD-up态周围的子域1和2的协同运动,这些子域被建模为弹性变形。

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virusMED(病毒金属结合位点、表位和药物结合位点)是一个基于7041个实验确定的病毒蛋白结构中热点周围原子相互作用数据库的丰富互联网应用程序。

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