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冰结合蛋白FfIBPF.冰箱对PS1进行过表达、纯化、表征和结晶,并进行初步的X射线晶体学分析。

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测定了FfIBP的高分辨率晶体结构,该结构在帽头环区域显示出分子内二硫键和T-a/G-X(X)-T/N冰封图案。刚性封头环区域和结冰部位较大的表面积对FfIBP的防冻活性很重要。

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测定了FfIBP的高分辨率晶体结构,该结构在封盖头环区域显示出分子内二硫键和T-a/G-X(X)-T/N冰封图案。刚性封头环区域和结冰部位较大的表面积对FfIBP的防冻活性很重要。

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由于抗冻蛋白(AFP)超家族的结构同源性较低,目前AFP的分类标准尚不明确。新鉴定的冰结合蛋白(IBP),以AFP的功能命名,具有与冰相互作用的类似结构特征和功能。真核微生物Typhulaishikariensis(TisAFP)和Leucosporidium sp.(LeIBP)的IBP的鉴定和特性表明,它们都是糖基化的,在结合位点(IBS)上具有不规则的基序。IBP共享一个独特的右手β-螺旋,这提供了宽范围相互作用表面的优势。另一个由南极细菌冷黄杆菌PSI编码的IBP被测定为2.1°分辨率,以了解其结冰机制。与LeIBP和TisAFP的结构不同,FfIBP的结构显示在α2和α4之间的环区(覆盖区)存在分子内二硫键。在结构细化过程中,在Cys107和Cys124之间观察到这种二硫键的电子密度,Cys107与Cys124的Cβ–Cβ距离为3.9º。通过序列比对和IBP的结构比较,我们在IBP中定义了两组,这取决于α2和α4环区域之间的序列差异以及二硫键的存在。此外,为了研究覆盖区对FfIBP活性和稳定性的影响,我们测定了FfIBP和LeIBP覆盖区互换突变体的晶体结构并测量了其热稳定性(mFfIBP-mLeIBP)。在热变性实验中,很明显,FfIBP的封头区域比LeIBP的更稳定,对IBP的整体稳定性很重要,尽管它与防冻活性没有直接关系。

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Daresbury-Laue软件源代码和信息的网络链接已从简单的谷歌搜索中隐藏。本附录明确了现在可以在哪里找到软件源代码和信息。



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