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生物分子的三维结构提供了对其功能的深入了解。利用X射线自由电子激光(XFEL)散射实验,可以在与自然环境相似的条件下观察难以结晶的生物分子。然而,从XFEL数据中解析3D结构并非没有挑战。例如,为了获得足够的衍射信号,需要强大的光束强度,并且需要估计光束与分子的入射角,以获得具有显著噪声的衍射图案。因此,定量评估实验条件(如数据量及其质量)如何影响最终3D模型的预期分辨率非常重要。在本研究中,作为一个例子,显示了从模拟产生的二维衍射图案恢复核糖体的三维结构。使用针对不同光束强度模拟的衍射图案和使用不同数量的衍射图案进行测试。建立了切片匹配三维重建程序的参数选择指南。此外,还讨论了XFEL实验条件对获得衍射图案的最低要求,以将分子结构重建到几纳米的高分辨率。

支持信息

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可移植文档格式(PDF)文件https://doi.org/10.107/S1600577518005568/yn5028sup1.pdf
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