胆碱氧化酶来自球状节杆菌参与胆碱合成甘氨酸甜菜碱，其机制和结构特性已被广泛表征。尽管获得了关于酶的知识，但底物进入活性位点的细节还没有完全了解。葡萄糖-甲醇-胆碱酶超家族所描述的“环盖”机制尚未得到胆碱氧化酶的证实。相反，分子动力学提出了在酶的溶剂可及表面上的疏水团簇，以控制底物对活性位点的访问。在此，酶的晶体结构与甘氨酸甜菜碱在pH 6.0，分辨率1.95º的络合物中溶解，从而对活性位点中的配体-酶相互作用进行结构描述。这种结构是胆碱氧化酶与生理相关配体复合体的第一个结构。带配体和不带配体的蛋白质结构几乎完全相同，但二聚体界面上有一个环除外，该环具有两种不同的构象。环250-255的不同构象定义了由二聚体另一亚单位上的疏水簇所界定的拟议活性位点入口的不同可接近性，表明其在调节底物对活性位点的访问方面起作用。
