常规结构纸（有机化合物）

《水晶学报》。(1993).C49,1530-1532
https://doi.org/10.107/S0108270193002069

Boc-Phe的结构-D类-Leu-Thr-OMe公司

M.Doi先生,Y.输入,田中先生,井上先生和T.石田

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KNI-272，一种高选择性和高效肽HIV蛋白酶抑制剂

M.Doi先生,T.石田,Y.Katsuya先生,佐佐木先生,T.谷口,H.长谷川,T.Mimoto公司和Y.Kiso先生

Kynostatin{KNI-272；系统名称：3-[3-苄基-2-羟基-9-（异喹啉-5-基氧基）-6-甲基磺胺基甲基-5,8-二氧-4,7-二氮杂壬酰基]-N个-第三种-丁基-1,3-噻唑烷-4-甲酰胺}，一种含有异苯基去甲抑素的高选择性和有效的HIV蛋白酶抑制剂[（2S公司,3S公司)-3-氨基-2-羟基-4-苯基丁酸]已结晶为水合物C₃₃H（H）₄₁N个₅O（运行）₆S公司₂·0.803小时₂O、来自水性己二醇。观察到的结构中苯基的无序与水合模式有关。分子骨架构象扭曲，游离抑制剂的整体构象与在其与HIV蛋白酶复合物中观察到的构象相似。

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N个-[3-（细胞分裂素-1-基）丙酰基]-L（左）-异亮氨酸，一种高度水合结构，在不对称单元中有四个胞嘧啶-异亮氨酸杂交体

M.Doi先生,K.Tsunemici先生,A.浅野,M.塔鲁,T.石田和M.Shiono先生

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A类-转achatin-I，H的反义类似物-D类-天冬氨酸-[CONH公司]-D类-阿拉-L（左）-Phe-Gly-OH公司

M.Doi先生,A.浅野,T.石田,H.米纳卡塔和K.Nomoto公司

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N个-苄基-N个-(第三种-丁氧基羰基）甘氨酸，anN个-取代甘氨酸（肽）单体

M.Doi先生,基诺希塔,A.浅野,R.尤内达,T.Kurihara公司和T.石田

标题化合物C₁₄H（H）₁₉不₄是一种氨基酸模拟物，在中心对称的空间群中从乙酸乙酯溶液中结晶。侧链和主链之间的距离比通常在氨基酸中发现的短。位置从-碳到氮在侧链和第三种-丁基。

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冲绳海绵体十三肽内酯-茶内酯内酯Id的高度溶解结构西奥内拉·斯温霍伊

M.Doi先生,T.石田,小林先生,J.R.德尚和J.L.Flippen-安德森

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胞嘧啶和色氨酸混合二肽：胞嘧啶-L（左）-色氨酸-水（2/6）

M.Doi先生,M.塔鲁,绪方先生,A.浅野和T.石田

标题化合物2（C）的杂合二肽₁₈H（H）₁₉N个₅O（运行）₄).6小时₂O、含有胞嘧啶碱和L（左）-色氨酸以六水形式结晶；溶剂占不对称单元重量的12%。通过吲哚环的不同方向区分了两个独立的分子。标题化合物的所有极性原子都参与氢键的形成，并且通过与溶剂介导的氢键结合来构建紧密的网络。A类-吲哚与核酸之间存在电子相互作用；它由氢键促进。

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高选择性HIV蛋白酶抑制剂KNI-272的刚性骨架部分：甲醇、丙酮和二甲基亚砜溶剂化形式的3-[3-苄基-2-羟基-9-（异喹啉-5-酰氧基）-6-甲基磺胺基甲基-5,8-二氧基-4,7-二氮酮酰基]-N个-第三种-丁基-1,3-噻唑烷-4-甲酰胺

M.多伊,T.木村,T.石田和Y.Kiso先生

KNI-272是一种高选择性HIV蛋白酶抑制剂，其晶体在三种不同的溶剂系统中生长。羟甲基羰基部分周围的局部构象在所有三种形式中都相似，在C-终端区域。非复合形式的构象特征与KNI-272-HIV蛋白酶复合物中抑制剂的构象相似。这表明C-KNI-272的末端区域是刚性的或非常稳定的。

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Boc-Phe的结构-D类-Leu-OMe公司

M.Doi先生,Y.输入,K.Ikuma公司,井上先生和T.石田

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合成离子载体的结构特性德国劳埃德船级社₂E类₄非对映体，18元环状内酯四环氧化合物，X射线晶体分析：晶体结构与钙的可能关系²⁺-运输能力

M.Doi先生,Y.输入,T.西野,T.石田,井上先生,H.涉谷,K.Ohashi先生,N.成田和一、北川

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内皮素抑制剂BQ123的笼状和簇状结构(-D类-Trp公司-D类-天冬氨酸^--专业-D类-Val-Leu-） $\cdot（光盘）$ 纳⁺在钠离子和肽之间形成五个和六个配位键

M.Doi先生,A.浅野,T.石田,Y.胜也,Y.Mezaki先生,佐佐木先生,A.Terashima公司,T.谷口,H.长谷川和M.Shiono先生

BQ123是一种环状五肽和一种有效的内皮素-1抑制剂。BQ123钠盐的晶体结构被确定为内皮素抑制剂的第一个例子。

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合成离子载体的结构特性德国劳埃德船级社₂E类₄非对映体，18元环状内酯四环氧化合物，X射线晶体分析：晶体结构与钙的可能关系²⁺-运输能力。附录

M.Doi先生,Y.输入,T.西野,T.石田,井上先生,H.涉谷,K.Ohashi先生,N.成田和一、北川

附录《水晶学报》（1995），B51, 1045-1050.

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κ-激动剂U-50488的结构

M.Doi先生,T.石田和井上先生

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四乙酸核黄素和四丁酸核黄素的结构：四羧酸核黄素分子堆积模式及其广泛堆积和氢键结合特性

M.埃比塔尼,Y.输入,T.石田,K.-i.坂口幸一,J.L.Flippen-安德森和I.L.卡勒

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鸟氨酸单磷酸脱羧酶催化中的底物畸变

藤桥先生,T.石田,黑田东彦,K.米托,L.Kotra公司,E.Pai公司和K.米奇

酶影响其催化反应的一种方式是通过过渡态稳定。另一个需要考虑的因素是底物畸变的影响，尽管只有少数几种酶对此进行了详细描述。我们对一磷酸鸟氨酸脱羧酶（ODCase）的反应机制有着长期的兴趣，并以1.5º左右的分辨率测定了与畸变底物结合的各种晶体结构。这种酶被称为最有效的酶之一，可加速5’-单磷酸鸟氨酸（OMP）的脱羧反应，形成17个数量级的5’-一磷酸尿苷（UMP）。反对底物畸变对ODCase反应的贡献的一个论点是UMP的弱亲和力。到目前为止观察到的畸变都出现在嘧啶环的C6取代物上，对应于OMP的羧酸盐。由于羧酸盐被反应去除，如果C6取代基的畸变有助于催化，则产物UMP应比OMP更紧密地与ODCase结合。为了研究这种不一致性，我们用UMP在原子分辨率（1.03Å）下确定了ODCase的晶体结构。该结构表明UMP和催化残基K72之间存在不利的相互作用，这种相互作用被认为在OMP络合物中不存在。表面等离子共振分析表明，UMP与K72A突变体的结合比与野生型酶的结合强5个数量级。这些分析否定了底物畸变对ODCase催化作用的贡献的论点。最后，我们使用计算模拟方法估计了畸变对催化作用的贡献。结果表明，ΔΔG⁄值下降10-15%是由基底畸变引起的。

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