人类溶质载体(SLC)转运体是药物开发的重要靶点。基于结构的SLC转运蛋白药物发现需要描述其结构、动力学以及与小分子配体和离子的相互作用机制。最近对人类SLC转运体及其同系物的原子结构的测定,加上改进的计算能力和预测方法,使得基于结构的药物设计方法对人体SLC成员的适用性增加。在这篇综述中,我们概述了SLC转运蛋白的结构和转运机制。然后,我们描述了计算技术,如同源建模和虚拟筛选,它们正在成为发现人类SLC成员化学探针的关键工具。我们通过案例研究来说明这些方法的实用性,在这些案例研究中,使用了合理的计算和实验集成来描述运输关键营养素和代谢物的SLC成员,包括氨基酸转运蛋白LAT-1和ASCT2,柠檬酸循环中间转运蛋白SLC13家族,和葡萄糖转运蛋白GLUT1。最后,我们简要讨论了人类SLC超家族基于结构的药物发现的未来方向,该超家族是人类结构和功能最多样化的蛋白质家族之一。