MHC I类(MHC I)-限制性病毒特异性CTL被认为是控制这种自然发生的慢病毒和对马成功应用马传染性贫血弱毒疫苗的保护性免疫反应的关键成分。然而,马MHC I如何呈现表位肽的结构基础尚不清楚。在本研究中,我们通过重折叠重组分子的能力和热稳定性研究了几种马传染性贫血病毒衍生表位肽的结合,然后通过测定五种肽MHC I复合物的x射线结构:马MHC I类等位基因(Eqca)-N*00602/Env-RW12、Eqca-N*00602/Gag-GW12、,Eqca-N*00602/修订版QW11、Eqca-N*00602/Gag-CF9和Eqca.N*00601/Gag-GW12。虽然Eqca-N*00601和Eqca-N*00602在单个氨基酸上存在差异,但当结合类似的CTL表位Gag-GW12时,Eqca.N*00601呈现出截然不同的肽呈现;结果表明,之前报道的功能在这两个等位基因之间是非交叉识别的。与9聚体肽复合的结构加上Eqca-N*00602特别值得注意,因为我们阐明了与Gag-GW12的复合物与Env-RW12相比表位肽中心的表观灵活性的差异,以及具有正常长度的表位肽的严格选择。马MHC I分子对长肽的特征性偏好和非常规表达为解释马的特殊抗慢病毒免疫提供了结构基础。我们认为,有益的参考点可以作为其他人类或动物慢病毒的初始平台。